抵销基础丧失后，双方互付债务的处理需根据抵销的具体情形及法律规定综合判断，核心结论如下：
法定抵销基础丧失后的处理
若原抵销符合《民法典》第568条规定的法定抵销要件（如债务种类、品质相同，到期且无禁止抵销情形），但因后续事实导致抵销基础丧失（如一方债务被撤销、无效或附条件未成就），则原抵销行为自始无效或失效。此时：
- 债务恢复原状：双方互负的债务恢复至抵销前的状态，需按原合同约定履行；
- 损害赔偿：若一方因抵销基础丧失存在过错（如恶意隐瞒债务瑕疵），需向对方承担违约责任或侵权责任；
- 例外情形：若抵销基础丧失系因不可抗力或对方原因导致，可能适用情势变更原则，双方可协商变更或解除合同。
约定抵销基础丧失后的处理
若抵销系双方通过协议约定（《民法典》第569条），且抵销基础丧失系因约定条件未成就或协议被撤销，则：
- 协议无效或撤销：抵销条款自始无效，双方需按原债务关系履行；
- 重新协商：双方可就剩余债务的清偿方式、期限等重新达成补充协议；
- 强制履行与救济：若一方拒绝履行原债务，对方可诉请法院强制履行，并主张逾期利息或违约金。
抵销基础丧失后的程序性处理
- 通知义务：抵销基础丧失后，主张恢复原状的一方需及时通知对方，否则可能承担未通知导致的损失；
- 抗辩权行使：若一方已部分履行债务，可就已履行部分向对方主张不当得利返还或抗辩；
- 诉讼时效中断：抵销基础丧失可能引发新的债权债务关系，诉讼时效从知道或应当知道权利受损之日起重新计算。
实务建议：
- 抵销前应严格审查债务的合法性、有效性及可抵销性，避免因基础瑕疵导致抵销失效；
- 抵销后若发生基础丧失情形，建议立即固定证据（如通知记录、协议文本等），并通过书面形式与对方协商解决方案；
- 若协商无果，应及时委托律师分析法律风险，并考虑通过诉讼或仲裁程序确认债务状态及责任承担。
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