结论：在合法的宅基地上翻新房屋但未报建，一般情况下会被认定为违章建筑，但也存在特定情况可能不被视为违建。以下是对此问题的详细分析：
一般情况下的规定
报建手续的必要性：
- 根据《中华人民共和国城乡规划法》及《村庄和集镇规划建设管理条例》等相关法律法规，宅基地上建造房屋等建筑物、构筑物，需经过审批报建程序。这包括向相关部门提交建房申请，并获得乡村建设规划许可证等证件后方可动工。
- 报建程序的设置旨在确保建设活动符合城乡规划、土地利用总体规划，以及满足建筑安全、消防等要求，从而保障公共利益和公共安全。
未报建的法律后果：
- 若未履行这些法定的报建手续而擅自开工，即使宅基地本身合法，所建房屋也可能被认定为违法建筑。相关部门有权采取一系列法律措施，如责令停工、罚款，甚至拆除建筑物。
特殊情况下的考量
历史遗留问题：
- 由于过去农村地区管理不规范或法律法规不完善，部分农民在未严格履行报建手续的情况下建房。对于这类因历史原因形成的未报建房屋，政府可能会根据具体情况进行妥善处理，而非一概而论地认定为违建并拆除。
符合规划且不影响公共利益：
- 若未报建的房屋符合当地土地利用总体规划和乡村建设规划，且未对公共安全、公共卫生、相邻关系等造成不利影响，有些地方可能允许及时补办报建手续，而不将其认定为违建。
法律建议
了解当地规定：
- 在宅基地上翻新房屋前，务必了解清楚当地的报建流程和规定，确保翻新行为合法合规。
履行报建手续：
- 按照当地规定，向村委会提出申请，经审核通过后上报乡镇政府或相关宅基地管理部门，获得建设工程规划许可证或乡村建设规划许可证等批准文件后再动工。
确保翻新符合规划：
- 翻新时需严格按照批准的面积、层数、高度、风貌等要求进行，不得超出审批范围，确保翻新后的房屋符合当地土地利用总体规划和乡村建设规划。
保证工程质量：
- 翻新的房屋必须符合国家的工程质量标准，确保建筑安全，避免质量隐患。
总结：宅基地房屋翻新未报建是否合法，需根据具体情况判断。在一般情况下，未报建会被认定为违章建筑；但在特定情况下，如历史遗留问题或符合规划且不影响公共利益，可能不被视为违建。为避免不必要的麻烦和损失，建议在翻新前务必了解清楚当地规定并履行报建手续。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。