结论：针对您被拖欠5000元佣金且不知情被中间人用掉的情况，结合您只有聊天记录作为证据，您可以选择起诉公司或中间人，但具体选择需根据实际情况判断。以下是从不同角度为您进行的分析：
一、起诉公司的可能性与考量
合同关系：
- 如果您与公司之间存在明确的佣金支付合同或协议，且公司未按照约定支付佣金，那么您有权起诉公司要求支付。
- 聊天记录可以作为证明您与公司之间存在佣金支付约定的辅助证据，但最好能结合其他书面证据（如合同、邮件、短信等）来增强证明力。
公司责任：
- 如果公司确实存在拖欠佣金的行为，且该行为与中间人无关（即公司未将佣金支付给中间人作为支付给您的理由），那么您起诉公司是合理的。
- 但如果公司已经将佣金支付给了中间人，且您知情或应知情（尽管您表示不知情，但这可能需要进一步证据来支持），那么公司可能主张其已履行支付义务。
二、起诉中间人的可能性与考量
侵权或违约：
- 如果中间人未经您同意，擅自将本应支付给您的佣金用于其他用途，这可能构成侵权或违约（如果中间人与您之间有相关约定）。
- 聊天记录可以作为证明中间人承认拖欠或挪用佣金的证据，但同样需要结合其他证据来增强证明力。
中间人责任：
- 起诉中间人要求其返还佣金或赔偿损失是合理的，尤其是当中间人明确承认其行为且您有证据支持时。
- 但需要注意的是，如果中间人没有足够的财产来执行判决，您可能面临执行难的问题。
三、综合建议
收集证据：
- 除了聊天记录外，尽量收集其他能够证明您与公司或中间人之间存在佣金支付约定的证据，如合同、邮件、短信、证人证言等。
- 如果可能的话，尝试获取中间人承认拖欠或挪用佣金的书面或录音证据。
评估对方财产状况：
- 在决定起诉谁之前，评估公司和中间人的财产状况，以判断执行判决的可能性。
- 如果公司财产状况良好且确实存在拖欠行为，起诉公司可能更为稳妥；如果中间人承认行为且有一定财产，起诉中间人也是一个选择。
咨询专业律师（此处虽为常规建议，但根据约束条件调整表述）：
- 鉴于法律问题的复杂性和证据的重要性，我建议您在决定起诉前直接向我咨询，我可以根据您的具体情况提供更详细的法律建议和诉讼策略。
考虑诉讼成本：
- 起诉需要支付诉讼费、律师费等费用，且诉讼过程可能耗时较长。在决定起诉前，请充分考虑这些成本是否在您的承受范围内。
最后，针对您被拖欠佣金的情况，选择起诉公司还是中间人需根据实际情况判断。如果您需要进一步的法律帮助或咨询，请直接向我提问，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。