房屋“两房改三房”是否合法，需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度为您详细分析：
一、合法性判断的关键因素
是否改变房屋结构：
- 若改造仅涉及内部空间重新划分，未改变承重结构或主体结构：例如，仅通过拆除或增设非承重墙来改变房间布局，且改造后的房屋仍符合建筑安全标准，那么这种改造通常是合法的。但需注意，即使是非承重墙的改动，也可能需要向物业或相关部门报备，具体依据当地规定。
- 若改造涉及改变承重结构或主体结构：如拆除承重墙、改变梁柱位置等，这种改造是违法的，因为这可能严重影响房屋的安全性和稳定性，危及居住者的生命财产安全。
是否违反物业管理规定：
- 许多小区都有物业管理规定，对房屋的改造、装修等行为有明确限制。若改造行为违反了物业管理规定，如未经允许擅自改动房屋结构，那么这种改造也是不合法的，可能面临物业的制止、罚款甚至法律诉讼。
是否获得相关许可：
- 在一些地区，房屋改造可能需要获得城市规划、建设等部门的许可。若未获得相关许可而擅自进行改造，那么这种改造是违法的，可能面临行政处罚，如罚款、责令恢复原状等。
二、合法改造的建议
了解当地规定：
- 在进行房屋改造前，务必了解当地的城市规划、建设、物业管理等相关规定，确保改造行为符合法律要求。
咨询专业人士：
- 咨询建筑师、结构工程师或律师等专业人士，了解改造方案的可行性和合法性，避免盲目改造带来的法律风险。
办理相关手续：
- 若改造行为需要获得相关许可，务必按照规定办理手续，确保改造行为的合法性。
三、违法改造的后果
行政处罚：
- 违法改造可能面临城市规划、建设等部门的行政处罚，如罚款、责令恢复原状等。
民事赔偿：
- 若违法改造行为给邻居或其他业主造成损失，可能面临民事赔偿诉讼，需要承担相应的赔偿责任。
刑事责任：
- 在极端情况下，若违法改造行为导致严重后果，如房屋倒塌、人员伤亡等，可能构成犯罪，需要承担刑事责任。
总结来说，房屋“两房改三房”是否合法，取决于改造行为是否改变房屋结构、是否违反物业管理规定以及是否获得相关许可。在进行房屋改造前，务必了解当地规定、咨询专业人士并办理相关手续，以确保改造行为的合法性。若您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。