年休假计入考勤是合法的，但具体计入方式需符合法律法规的规定。以下从不同角度为你详细分析：

法律法规依据

根据《职工带薪年休假条例》以及相关劳动法律法规，职工享有带薪年休假的权利，这是职工的法定福利。年休假期间，职工应享受与正常工作期间相同的工资收入。在考勤管理上，企业可以将年休假计入考勤，但应明确标注为“年休假”状态，而非“缺勤”或“事假”等，以确保职工的年休假权益不受侵害。

合法计入考勤的情形

1. 明确标注年休假：企业在考勤记录中明确标注职工休的是年休假，这样既能体现职工的休假情况，又能保障其工资收入不受影响。
2. 不影响工资发放：年休假期间，职工应享受与正常工作期间相同的工资待遇。如果企业因将年休假计入考勤而扣减职工工资，则属于违法行为。

非法计入考勤的情形及后果

1. 将年休假视为缺勤或事假：如果企业将职工的年休假错误地记录为缺勤或事假，并据此扣减工资或进行其他处罚，这违反了劳动法律法规的规定。职工有权要求企业纠正错误，并补发被扣减的工资。
2. 未享受年休假却计入考勤：如果企业未安排职工享受年休假，却将年休假天数计入考勤作为已休假处理，这也是违法的。职工有权要求企业安排补休或支付未休年休假的工资报酬。

实际操作建议

1. 完善考勤制度：企业应完善考勤制度，明确年休假的记录方式，确保职工的年休假权益得到保障。
2. 加强沟通与培训：企业应加强与职工的沟通，明确告知年休假的政策和使用方式。同时，对考勤管理人员进行培训，确保他们正确理解和执行年休假政策。
3. 及时处理争议：如果职工对年休假的计入方式有异议，企业应及时与职工沟通协商，寻求解决方案。如果无法协商解决，职工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

总结来说，年休假计入考勤本身是合法的，但必须确保计入方式符合法律法规的规定，不影响职工的工资收入和休假权益。如果你在年休假或工资福利方面遇到任何问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。