针对您提出的“乡村规划法中违章建筑由哪个部门管理”的问题，这是一个涉及多个政府部门协同合作的管理事项。以下是我为您提供的详细解答：

在乡村规划法框架下，违章建筑的管理主要涉及以下几个关键部门：

1. 乡（镇）人民政府：

   • 作为基层政府部门，乡（镇）人民政府在农村违规建筑管理中扮演着至关重要的角色。它们负责乡村规划的组织实施和监督管理工作，对未依法取得乡村建设规划许可证或未按许可证规定进行建设的行为，有权责令停止建设、限期改正；若逾期不改正，还可以组织拆除违规建筑。

2. 县级自然资源部门：

   • 县级自然资源部门负责土地资源和城乡规划管理。在农村违规建筑管理中，它们主要查处涉及违反土地利用总体规划、非法占用农用地等行为。依据相关法律法规，自然资源部门有权责令退还非法占用的土地，并限期拆除在非法占地上新建的建筑物和其他设施。

3. 县级农业农村部门：

   • 县级农业农村部门专注于农村宅基地管理。对于违规占用宅基地建房、超标准多占宅基地等问题，农业农村部门有权进行监督和查处。它们依据相关规定，对未经批准或采取欺骗手段骗取批准，非法占用宅基地建住宅的行为，可依法进行处理。

综合说明：

• 农村违规建筑的管理是一个综合性的工作，需要乡（镇）人民政府、县级自然资源部门和县级农业农村部门等多个部门协同合作。各部门依据其法定职责，共同维护农村建筑秩序。
• 在实际操作中，若您发现农村违规建筑，可以先向当地自然资源部门报告，由其进行初步调查和认定。若涉及乡村规划或宅基地管理问题，您也可以同时向乡（镇）人民政府或农业农村部门寻求协助。
• 各部门在处理农村违规建筑时，会严格遵循法律法规，确保执法行为的合法性和公正性，同时保护农民的合法权益，促进农村社会的和谐稳定。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。