针对您提出的“施工合同无效且工程不合格”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、合同无效的确认
首先，我们需要明确施工合同为何会被认定为无效。根据相关法律法规，施工合同可能因违反法律法规的强制性规定、承包人未取得相应资质、借用资质、违法转包或分包、违反法定建设程序或未取得必要的许可证等情形而被认定为无效。确认合同无效是后续处理的基础。
二、工程质量评估与处理
初次验收不合格：
- 若工程初次验收不合格，承包人应承担修复责任，并承担修复费用。修复后，应再次进行验收。
修复后验收合格：
- 如果工程经承包人修复后再次验收合格，承包人仍有权请求支付工程价款，但需扣除修复费用。这是因为承包人虽然完成了工程，但因其初始工程质量问题导致了额外的修复成本。
无法修复或修复后仍不合格：
- 若工程无法通过修复达到合格标准，承包人则无权请求支付工程价款。此时，发包人不仅无需支付工程款，还可能根据合同条款或法律规定追究承包人的违约责任或赔偿责任。
三、过错方的损失赔偿责任
- 在合同无效且工程不合格的情况下，对于因此导致的损失，应由过错方对另一方承担相应的赔偿责任。赔偿金额应结合双方的过错程度、因果关系等因素进行确定。例如，如果发包人因不合理压缩工期或提供不合格材料导致工程质量问题，发包人应承担相应损失赔偿责任。
四、非法所得的收缴与争议解决
非法所得收缴：
- 如果承包人或发包人通过非法手段获取利益，如行贿、欺诈等，人民法院可依法收缴其非法所得。这是为了维护市场秩序和公平竞争环境。
争议解决途径：
- 在合同无效且工程不合格的情况下，当事人可通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决因工程价款、质量等问题产生的争议。建议双方首先尝试通过协商或调解解决争议，以节省时间和成本。如果无法达成一致意见，再考虑通过仲裁或诉讼等法律途径解决。
五、建议与总结
- 建议：为了避免施工合同无效及工程不合格带来的法律风险和经济损失，合同双方在签订合同时应严格遵守相关法律法规和程序规定，确保合同内容合法有效。同时，在施工过程中应加强质量管理，确保工程质量符合相关标准和要求。
- 总结：处理施工合同无效且工程不合格的问题需要综合考虑多个方面，包括合同无效的确认、工程质量评估与处理、过错方的损失赔偿责任、非法所得的收缴与争议解决等。合同双方应依据相关法律法规和公平、合理的原则进行处理，并尽可能通过协商或调解解决争议。如果无法协商一致，可依法通过诉讼或仲裁等途径解决争议。