公司有明确的制度规定犯了什么事罚多少钱，这一行为本身并不直接违法，但具体是否合法需视制度内容、制定程序及执行方式是否符合法律法规而定。以下从几个关键角度进行分析：
一、制度内容的合法性
罚款的合理性：
- 公司制度中的罚款应当基于合理的理由，如员工违反公司规章制度、造成公司损失等。罚款的数额应当与违规行为的严重程度、造成的损失大小相匹配，不能随意设定高额罚款。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，公司对员工进行罚款应当有明确的法律依据或合同约定，且罚款金额应合理。
禁止性规定：
- 公司制度不得违反法律法规的强制性规定，如不得设定违反劳动法、劳动合同法等法律的罚款条款。
- 示例：若公司制度规定“员工迟到一次罚款1000元”，这样的条款可能因罚款金额过高而被视为违法，因为它超出了合理范围，且可能违反劳动法中关于工资支付和扣除的规定。
二、制定程序的合法性
民主程序：
- 公司制度的制定应当遵循民主程序，如经过职工代表大会或全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或职工代表平等协商确定。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
公示或告知：
- 公司制度制定后，应当向劳动者公示或告知，确保劳动者了解并遵守。
- 示例：公司可以通过内部公告、员工手册、电子邮件等方式将制度内容告知员工。
三、执行方式的合法性
罚款的扣除：
- 公司从员工工资中扣除罚款时，应当确保扣除后的工资不低于当地最低工资标准，且扣除的金额和方式应当符合法律法规的规定。
- 法律依据：根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
记录与证明：
- 公司在对员工进行罚款时，应当有明确的记录和证明，如违规行为的证据、罚款的决定书等，以备员工查询或申诉。
四、法律后果与建议
法律后果：
- 如果公司制度中的罚款条款违法或制定程序不合法，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司撤销违法条款、返还违法扣除的罚款等。
- 示例：若员工因公司违法罚款而提起劳动仲裁，仲裁机构可能会裁决公司返还罚款并支付相应的经济补偿。
建议：
- 公司在制定罚款制度时，应当咨询专业律师或法律顾问，确保制度内容合法、制定程序合规。
- 公司在执行罚款制度时，应当严格遵守法律法规的规定，确保罚款的合理性、合法性和透明性。
总结来说，公司有明确的制度规定犯了什么事罚多少钱并不直接违法，但具体是否合法需视制度内容、制定程序及执行方式是否符合法律法规而定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。