离职补偿金的发放主体需根据劳动关系主体及实际用工情况确定，并非绝对由分公司或总公司发放，具体分两种情况：

1. 若劳动者与分公司签订劳动合同，且分公司具备独立用工主体资格（如领取营业执照的分公司）
   根据《劳动合同法实施条例》第四条，分公司若依法取得营业执照或登记证书，可作为用人单位与劳动者建立劳动关系。此时离职补偿金应由分公司承担并直接发放，总公司无需直接介入。但若分公司财务不独立，总公司可能需承担连带责任（司法实践中需结合分公司偿付能力判断）。

2. 若劳动者与总公司签订劳动合同，或分公司未取得独立用工主体资格
   此时劳动关系主体为总公司，离职补偿金应由总公司发放。即使劳动者实际在分公司工作，分公司仅作为用工管理方，不改变劳动关系归属。例如：某集团下属未登记的分公司员工，其劳动合同与总公司签订，补偿金发放主体为总公司。

特殊情形补充说明：

• 若总公司与分公司存在内部协议约定补偿金承担方式（如由总公司拨款至分公司发放），该约定仅对内部有效，不影响劳动者向法定责任主体（合同签订方）主张权利。
  
• 跨地区用工时，需注意分公司所在地补偿标准（如社平工资）与总公司所在地的差异，但发放主体仍以劳动关系归属为准。

建议操作：

1. 核查劳动合同签订主体及分公司营业执照情况；
   
2. 保留工资发放记录、社保缴纳记录等证明实际用工关系的证据；
   
3. 若涉及跨主体发放，可要求出具书面说明（如总公司委托分公司代发协议）。
   

如有具体案例细节（如分公司资质、合同签订方等），可进一步向我说明，我会结合实际情况分析责任主体。