在行政诉讼中，被告不质证原告庭后四十天提交的书面质证意见，这一行为本身并不直接决定其合法性，关键在于是否符合法定程序和法院的要求。以下从几个角度进行详细分析：

1. 质证程序的一般规定：

   • 在行政诉讼中，质证是当事人对对方提出的证据进行质询、辩驳和确认的过程，是法庭调查的重要环节。
   • 通常，质证应当在法庭上进行，由当事人当庭对证据进行质询和辩驳。然而，法律也允许在特定情况下，如当事人因正当理由无法到庭时，通过书面形式进行质证。

2. 庭后提交书面质证意见的合法性：

   • 如果原告因正当理由（如疾病、出差等）无法在庭审时出庭质证，且提前向法院申请并获得了许可，那么庭后提交书面质证意见是合法的。
   • 被告是否需要对这些书面质证意见进行回应，取决于法院的具体指示和案件的具体情况。如果法院认为有必要，可能会要求被告在规定时间内提交书面反驳意见或进行口头质证。

3. 被告不质证的法律后果：

   • 如果被告选择不质证原告庭后提交的书面质证意见，这并不意味着这些意见自动被采纳或具有法律效力。法院仍然会根据案件事实、证据规则和法律规定，对双方提交的证据进行综合审查判断。
   • 被告不质证可能被视为放弃了对这些证据的质询和辩驳权利，但法院在判决时仍会考虑所有相关证据，包括原告提交的书面质证意见中可能揭示的事实和问题。

4. 实际操作中的建议：

   • 对于原告而言，如果因特殊原因无法在庭审时出庭质证，应提前向法院申请并说明理由，同时按照法院的要求提交书面质证意见。
   • 对于被告而言，如果收到原告庭后提交的书面质证意见，应及时与法院沟通，了解是否需要提交书面反驳意见或进行口头质证。即使选择不直接质证，也应密切关注案件进展，确保自己的权益不受损害。

总结来说，行政诉讼中被告不质证原告庭后四十天提交的书面质证意见，并不直接构成违法。关键在于是否符合法定程序和法院的要求，以及法院如何根据案件事实和证据规则进行综合审查判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。