合同上签的工程款滞纳金，在实质上更常被视为违约金，其合法性取决于多个因素，在满足一定条件下，该条款是合法的，并对双方具有约束力。以下从不同角度为您详细分析：
合法性条件
民事行为能力：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百四十三条，行为人需具有相应的民事行为能力，这是合同有效的前提之一。因此，签订合同双方必须具备完全民事行为能力，能够理解和承担合同条款所带来的法律后果。
真实意思表示：
- 同样依据《中华人民共和国民法典》第一百四十三条，合同应基于双方的自愿和真实意愿签订，不存在欺诈、胁迫等情形。这意味着，合同中的滞纳金条款必须是双方真实意思的表示，任何一方不得通过欺诈、胁迫等手段迫使对方接受不合理的条款。
合法合规性：
- 合同内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。这是《中华人民共和国民法典》第一百四十三条所明确要求的。因此，合同中的滞纳金条款必须合法合规，不得违反相关法律法规的规定。
法定依据或授权：
- 在某些特定领域或行业中，如法律法规明确允许或授权当事人约定“滞纳金”，则该约定合法。然而，在建设工程合同中，通常更侧重于违约金的约定，而非滞纳金。但无论如何，只要该约定不违反法律法规的强制性规定，即可视为合法。
数额的合理性：
- 合同中约定的滞纳金（违约金）数额应合理，不得过高以至于违反公平原则或相关法律法规。根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，如果约定的违约金低于或过分高于造成的损失，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加或适当减少。因此，在约定滞纳金时，应充分考虑实际损失情况，确保数额的合理性。
不合法的情况
- 违反法律强制性规定：如滞纳金数额过高，超出合理范围，可能被视为违反法律的公平原则和相关规定，从而被认定为无效。
- 主体不适格或缺乏法定授权：非行政机关或无法律赋予收取滞纳金权力的主体在合同中约定此条款，可能因缺乏法定依据而无效。在建设工程合同中，通常只有合同双方才有权约定违约金或滞纳金，第三方无权干涉。
法律建议
- 明确约定：在签订合同时，双方应明确约定滞纳金（违约金）的数额及计算方式，以避免后续争议。这有助于确保合同的公平性和合理性，减少不必要的法律纠纷。
- 合理设定：在设定滞纳金数额时，应充分考虑实际损失情况、行业惯例以及公平原则等因素，确保数额的合理性。避免设定过高或过低的滞纳金数额，以免引发法律纠纷或无法有效约束违约行为。
- 及时咨询：如遇纠纷或对合同条款有疑问，应及时向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。
综上所述，合同上签的工程款滞纳金在满足一定条件下是合法的，但双方当事人在签订合同时应谨慎考虑各项因素，确保合同的公平性、合理性和合法性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。