结论：私人老板拿补助扣社保是否合法需分情况讨论，具体取决于补助的性质、劳动合同约定以及相关法律法规的适用情况。以下从不同角度展开分析：

1. 补助的性质与社保缴纳的关联性

• 法定社保义务：根据《社会保险法》和《劳动合同法》，用人单位（包括私人老板）必须为员工缴纳社会保险（养老、医疗、失业、工伤、生育），这是法定义务，不得通过任何形式免除或转嫁。
• 补助的分类：
  • 工资性补助：如岗位津贴、交通补贴等，属于工资总额的一部分，老板无权从中扣除社保费用。社保应基于员工实际工资总额计算，由单位和个人分别承担法定比例。
  • 福利性补助：如节日慰问金、一次性奖励等，若明确为额外福利且不纳入工资总额，理论上老板可要求员工承担个人部分社保（需员工同意），但单位部分仍需由老板承担。
  • 专项补助：如政府发放的稳岗补贴、疫情补助等，若明确用于特定目的（如稳定就业），老板擅自扣减可能涉嫌违法，需根据补助文件具体条款判断。

2. 劳动合同与内部规定的合法性

• 合同约定优先：若劳动合同或规章制度中明确约定“补助可用于抵扣社保个人部分”，且该约定不违反法律强制性规定（如未低于最低工资标准），可能被认定为有效。但单位部分社保仍需由老板承担。
• 无效条款风险：若约定“补助包含单位应缴社保”或“员工放弃社保”，此类条款因违反《社会保险法》而无效，老板仍需补缴社保并可能面临行政处罚。

3. 法律风险与后果

• 行政处罚：根据《社会保险法》第86条，用人单位未按时足额缴纳社保的，由社保征收机构责令补缴，并自欠缴之日起按日加收万分之五的滞纳金；逾期仍不缴纳的，可处欠缴数额1倍以上3倍以下罚款。
• 劳动仲裁风险：员工可依据《劳动合同法》第38条以“未依法缴纳社保”为由解除劳动合同，并主张经济补偿金（按工作年限，每满1年支付1个月工资）。
• 刑事责任：若老板通过虚假手段逃避社保缴纳（如伪造工资表），数额较大或情节严重的，可能构成《刑法》第266条的诈骗罪。

4. 实务建议

• 对员工：
  1. 核查工资条，确认社保扣除是否合法（单位部分是否由老板承担）；
  2. 保留劳动合同、补助发放记录等证据；
  3. 可向当地社保局投诉或申请劳动仲裁，要求补缴社保并赔偿损失。
• 对老板：
  1. 严格区分工资与补助，避免混淆；
  2. 依法计算社保基数，确保单位和个人部分均足额缴纳；
  3. 如需调整社保缴纳方式，应与员工协商并签订书面补充协议。

总结：私人老板无权单方面以补助抵扣社保单位部分，个人部分扣除也需以合法约定为前提。若存在争议，建议根据具体证据和当地政策进一步分析，必要时可通过法律途径解决。如有进一步问题，可直接向我咨询。