在非法经营烟草的案件中，公安机关在侦查阶段确实有可能会调查涉案人员的行踪。这一行为主要基于以下几个方面的考虑：
侦查需要：
- 公安机关在侦查非法经营烟草等刑事案件时，需要全面收集证据，以查明案件事实。调查涉案人员的行踪是侦查工作的一部分，有助于公安机关了解涉案人员的活动轨迹、接触人员等信息，从而进一步挖掘案件线索，固定证据。
防止逃避侦查：
- 非法经营烟草的涉案人员可能会试图逃避公安机关的侦查和打击。通过调查行踪，公安机关可以及时掌握涉案人员的动态，防止其潜逃或销毁证据，确保侦查工作的顺利进行。
法律程序要求：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，公安机关在侦查阶段有权采取多种侦查措施，包括询问证人、查询、冻结存款汇款、搜查、查封、扣押物证、书证等。调查行踪作为侦查措施的一种，是公安机关依法履行职责的体现。
在调查行踪的过程中，公安机关会遵循以下原则：
合法性原则：
- 公安机关在调查行踪时，必须严格遵守法律法规的规定，不得侵犯涉案人员的合法权益。例如，不得非法搜查、扣押涉案人员的财物或非法限制其人身自由。
必要性原则：
- 公安机关在调查行踪时，应当根据案件的具体情况和侦查工作的需要，合理确定调查的范围和方式。避免过度调查或滥用侦查措施，确保侦查工作的针对性和有效性。
保密性原则：
- 公安机关在调查行踪过程中获取的信息，应当严格保密，不得泄露给无关人员。以防止涉案人员得知后采取逃避侦查的措施或干扰侦查工作的进行。
对于涉案人员而言：
- 如果被公安机关调查行踪，应当积极配合公安机关的工作，如实提供相关信息。不得隐瞒、谎报或拒绝提供信息，否则可能会面临法律责任。
- 同时，涉案人员也有权了解自己的合法权益和侦查工作的进展情况。如果认为公安机关的侦查行为存在违法行为或侵犯了自己的合法权益，可以向相关部门投诉或寻求法律援助。
最后需要强调的是，非法经营烟草是违法行为，不仅会对国家税收造成损失，还会扰乱市场秩序。因此，建议广大市民遵守法律法规，不要从事非法经营烟草等违法活动。如果遇到相关法律问题或需要法律帮助，可以直接向我咨询。