公司以发放时未在职为由拒绝发放相关款项（如年终奖、绩效奖等）的行为是否违法，需根据具体情况判断，但通常情况下，若该款项属于劳动报酬的一部分，公司的做法可能涉嫌违法。以下从不同角度详细分析：
一、法律背景与原则
劳动报酬的支付原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者有权获得与其劳动相对应的报酬，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
- 劳动报酬的支付不应受劳动者是否在职的单一因素影响，除非劳动合同或公司规章制度中有明确且合理的规定。
年终奖、绩效奖的性质：
- 年终奖、绩效奖等通常被视为劳动报酬的一部分，是劳动者全年劳动成果的体现。
- 如果这些奖项在劳动合同或公司规章制度中有明确规定，且劳动者符合获得条件，那么公司就有义务支付。
二、公司拒绝发放的可能情况与法律分析
劳动合同或规章制度中有明确规定：
- 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定，年终奖、绩效奖等需在发放时仍在职的劳动者才能获得，且这一规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司拒绝发放可能不构成违法。
- 但需注意：这样的规定应当合理，且不得损害劳动者的合法权益。如果规定过于苛刻或不合理，可能被视为无效。
劳动合同或规章制度中无明确规定：
- 如果劳动合同或公司规章制度中没有明确规定年终奖、绩效奖等的发放条件，那么公司以发放时未在职为由拒绝发放，可能缺乏法律依据。
- 在这种情况下，劳动者有权要求公司支付其应得的劳动报酬，包括年终奖、绩效奖等。
公司行为涉嫌违法的情况：
- 如果公司无正当理由拒绝支付劳动者的劳动报酬，包括年终奖、绩效奖等，且这一行为违反了劳动合同或公司规章制度的规定，或者违反了法律法规的强制性规定，那么公司的行为可能构成违法。
- 劳动者有权向劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，要求公司支付其应得的劳动报酬。
三、法律建议与行动指南
审查劳动合同和公司规章制度：
- 劳动者应首先审查自己的劳动合同和公司规章制度，了解年终奖、绩效奖等的发放条件和规定。
与公司协商：
- 如果劳动者认为自己符合获得年终奖、绩效奖等的条件，但公司拒绝支付，可以尝试与公司进行协商，寻求解决方案。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，要求公司支付其应得的劳动报酬。
- 在必要时，劳动者还可以提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
总结来说，公司以发放时未在职为由拒绝发放相关款项的行为是否违法，需根据具体情况判断。如果劳动者认为自己符合获得条件且公司无正当理由拒绝支付，可以寻求法律帮助来维护自己的权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。