若公司内部调查发现员工存在违规行为，公司应依法依规处理，具体步骤和注意事项如下：

1. 确认违规事实与证据

   • 事实确认：公司需确保调查程序合法合规，通过询问相关人员、调取监控、查阅文件等方式，全面收集证据，形成完整的证据链，以证明员工确实存在违规行为。
   • 证据固定：对收集到的证据进行妥善保存，如书面记录需由相关人员签字确认，电子证据需保留原始载体或进行公证，确保证据的真实性和有效性。

2. 依据公司规章制度处理

   • 规章制度审查：公司应首先审查自身的规章制度，确认该违规行为是否属于规章制度中明确禁止的行为，以及对应的处罚措施。
   • 处罚决定：根据规章制度的规定，结合违规行为的严重程度，作出相应的处罚决定，如警告、罚款、降职、解雇等。处罚决定应书面通知员工，并告知其申诉的权利和途径。

3. 遵循法定程序

   • 通知与听证：在作出解雇等严重处罚决定前，公司应依法通知员工，并给予其陈述和申辩的机会。对于可能涉及员工重大权益的事项，如解雇，公司还应考虑是否需要举行听证会。
   • 工会参与：如果公司设有工会，且员工的违规行为可能涉及解雇等严重后果，公司应事先将处理理由通知工会，并听取工会的意见。

4. 考虑特殊情况与人性化处理

   • 初犯与情节轻微：对于初犯且情节轻微的违规行为，公司可以考虑给予员工改正的机会，如发出警告信、要求参加培训等，而非直接采取严厉的处罚措施。
   • 员工态度与配合度：在处理违规行为时，公司还应考虑员工的态度和配合度。如果员工能够主动承认错误、积极配合调查并采取措施纠正违规行为，公司可以适当减轻处罚。

5. 防范法律风险与后续管理

   • 法律风险防范：公司在处理员工违规行为时，应确保所有程序均符合法律法规的规定，避免因程序违法而引发劳动争议或法律诉讼。
   • 后续管理：处理完违规行为后，公司应加强对员工的教育和管理，防止类似行为再次发生。同时，公司还可以考虑对规章制度进行修订和完善，以更好地适应公司发展的需要。

若公司在处理员工违规行为过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询。我会根据公司的具体情况和需求，提供专业、详细的法律建议和指导。