未及时清理超过保质期食品的处罚需根据具体违法情形确定，主要涉及行政处罚，情节严重可能涉及刑事处罚。以下分情况详细说明：

1. 行政处罚

   • 依据：根据《中华人民共和国食品安全法》第三十四条第十项规定，禁止生产经营标注虚假生产日期、保质期或者超过保质期的食品、食品添加剂。
   • 处罚措施：
     • 一般情形：由县级以上人民政府食品安全监督管理部门没收违法所得和违法生产经营的食品、食品添加剂，并可以没收用于违法生产经营的工具、设备、原料等物品；违法生产经营的食品、食品添加剂货值金额不足一万元的，并处五万元以上十万元以下罚款；货值金额一万元以上的，并处货值金额十倍以上二十倍以下罚款。
     • 情节严重情形：如果经营超过保质期的食品情节严重，如多次违法、造成严重后果等，食品安全监督管理部门可以责令停产停业，直至吊销许可证。

2. 刑事处罚（如构成犯罪）

   • 依据：根据《中华人民共和国刑法》第一百四十三条的规定，生产、销售不符合食品安全标准的食品，足以造成严重食物中毒事故或者其他严重食源性疾病的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；对人体健康造成严重危害或者有其他严重情节的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金；后果特别严重的，处七年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。
   • 适用情形：如果未及时清理超过保质期的食品，且该食品被销售并导致消费者健康受损，达到刑事立案标准的，将依法追究刑事责任。

3. 其他责任

   • 民事赔偿：如果因销售超过保质期的食品给消费者造成损害的，消费者还可以根据《中华人民共和国消费者权益保护法》的规定，要求经营者承担民事赔偿责任，包括赔偿损失、支付价款十倍或者损失三倍的赔偿金等。
   • 信用惩戒：对于存在严重违法失信行为的食品生产经营者，食品安全监督管理部门还可以将其列入严重违法失信名单，实施信用惩戒。

建议：为避免法律风险，食品生产经营者应建立严格的食品保质期管理制度，定期检查库存食品，及时清理超过保质期的食品，确保食品安全。如有具体法律问题，欢迎直接向我咨询。