结论：种畜农场承包土地退休后被收回是否合法，需根据具体情况判断，包括承包合同的约定、土地性质以及相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：

一、承包合同约定

1. 合同内容：首先，要查看承包合同中是否有关于退休后土地处理的具体条款。如果合同中明确规定了退休后土地的处理方式，如收回、继续承包或转让等，那么双方应按照合同约定执行。
2. 合同效力：如果合同中没有明确规定，或者规定不明确，那么需要依据相关法律法规和公平原则来判断。此时，合同的效力、双方当事人的真实意思表示以及合同履行过程中的实际情况等，都将成为判断的重要依据。

二、土地性质

1. 国有土地：如果种畜农场的土地属于国有土地，那么其承包、使用和管理需遵循国家关于国有土地的相关法律法规。在退休后，土地是否收回可能受到国家政策、土地管理规定以及承包合同等多重因素的影响。
2. 集体土地：如果土地属于集体所有，那么其承包、使用和管理需遵循集体土地的相关规定。在退休后，土地是否收回可能受到集体经济组织的规定、承包合同以及村民会议或村民代表会议的决议等因素的影响。

三、相关法律法规

1. 《农村土地承包法》：该法规定了农村土地承包的基本原则、承包期限、承包合同的内容以及土地承包经营权的流转等。在退休后，土地是否收回需遵循该法的相关规定，特别是关于承包期限和承包合同解除的规定。

   • 若承包合同未到期，且没有法定或约定的解除事由，那么发包方（如农场或集体经济组织）通常无权单方面收回土地。
   • 若承包合同已到期，或者存在法定或约定的解除事由（如承包方严重违反合同约定、土地被征收等），那么发包方有权收回土地。

2. 其他相关法律法规：除了《农村土地承包法》外，还可能涉及《土地管理法》、《物权法》等相关法律法规。这些法律法规可能对土地的使用、管理、流转等方面有具体规定，需结合具体情况进行判断。

四、实际操作建议

1. 查看合同：首先，建议查看承包合同的具体内容，了解双方的权利和义务以及合同中关于退休后土地处理的规定。
2. 咨询相关部门：如果合同中没有明确规定或者存在争议，建议咨询当地土地管理部门、农业部门或法律服务机构，了解相关法律法规和政策规定。
3. 协商解决：在了解相关法律法规和政策规定后，可以与发包方进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。
4. 法律途径：如果协商无果，且认为自己的权益受到侵害，可以通过法律途径维护自己的合法权益，如提起民事诉讼或申请仲裁等。

最后，种畜农场承包土地退休后被收回是否合法，需根据具体情况判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。