结论：行政事业单位为职工缴纳五险一金的账户被法院冻结是否合法，不能一概而论，需根据冻结原因、账户性质及法律规定综合判断。以下从不同角度进行分析：

1. 账户性质与冻结合法性

• 社保专用账户的特殊性：根据《社会保险法》及相关规定，社保基金（包括养老保险、医疗保险等）实行专款专用，任何组织或个人不得侵占或挪用。若冻结的是社保专用账户（如养老保险基金账户、医疗保险基金账户等），法院原则上不得冻结，除非涉及社保基金本身的违法犯罪（如贪污、挪用等）。
• 单位自有账户的冻结：若冻结的是行政事业单位的自有资金账户（如基本账户、一般账户等），且该账户资金并非专用于社保缴纳，法院可能因单位涉及债务纠纷（如借款、合同纠纷等）而依法冻结。此时，冻结行为本身不直接涉及社保缴纳的合法性，但可能间接影响单位按时缴纳社保的能力。

2. 冻结原因与法律程序

• 合法冻结的情形：法院冻结账户需基于生效法律文书（如判决书、裁定书）或执行申请，并依法向银行送达协助执行通知书。若冻结程序合法，且账户资金不属于法律明确禁止冻结的范围（如社保专用账户、国家财政专项资金等），则冻结行为合法。
• 违法冻结的情形：若法院冻结账户时未履行法定程序（如未送达协助执行通知书），或冻结了法律明确禁止冻结的资金（如社保专用账户、救灾资金等），则冻结行为违法。此时，单位或职工可向法院提出执行异议，要求解除冻结。

3. 对职工权益的影响与救济

• 社保缴纳中断的风险：若账户冻结导致单位无法按时缴纳社保，职工可能面临社保断缴、待遇享受受限等问题。此时，职工可向单位或社保部门反映情况，要求单位尽快解决资金问题或补缴社保。
• 法律救济途径：若冻结行为违法或侵害职工权益，职工或单位可依法向法院提出执行异议或申请复议。必要时，可寻求律师帮助，通过法律途径维护权益。

4. 实务建议

• 单位角度：行政事业单位应加强财务管理，确保社保缴纳资金专款专用，避免因债务纠纷导致账户被冻结。若账户被冻结，应及时与法院沟通，说明账户性质及资金用途，争取解除冻结。
• 职工角度：职工应关注社保缴纳情况，若发现断缴或异常，及时向单位或社保部门查询原因。若因账户冻结导致权益受损，可依法维权。

总结：行政事业单位为职工缴纳五险一金的账户被法院冻结是否合法，需结合账户性质、冻结原因及法律程序综合判断。若涉及社保专用账户或冻结程序违法，职工或单位可依法提出异议。如有具体案件或疑问，可直接向我咨询，我将结合案情提供专业法律意见。