结论：因事假离职公司扣发工资是否合法，需根据具体情况判断。若公司规章制度合法且事假扣发工资的规定合理，则合法；若公司规章制度不合法或事假扣发工资的规定不合理，则不合法。
分析说明：
公司规章制度合法且事假扣发工资规定合理的情况：
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位有权根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。同时，劳动者因个人原因请假，用人单位有权根据规章制度扣除相应工资。
- 合理性判断：若公司规章制度中明确规定了事假扣发工资的具体标准，且该标准合理（如按照请假天数、请假期间应发工资的一定比例等扣除），且该规章制度已经过民主程序制定并公示，或者已经告知劳动者，则公司扣发工资的行为是合法的。
公司规章制度不合法或事假扣发工资规定不合理的情况：
- 规章制度不合法：若公司规章制度未经过民主程序制定、未公示或未告知劳动者，或者规章制度的内容违反法律、行政法规的规定，则该规章制度不合法，公司依据该规章制度扣发工资的行为也是不合法的。
- 扣发工资不合理：即使公司规章制度合法，但如果事假扣发工资的规定不合理，如扣除的工资数额过高、扣除方式不公平等，也可能被认定为不合法。例如，如果公司规定事假一天扣除当月全部奖金或绩效工资，这种规定可能因过于苛刻而被认定为不合理。
特殊场景：
- 劳动者未请假擅自离岗：如果劳动者未按照公司规定请假擅自离岗，公司有权根据规章制度进行处罚，包括扣发工资。但同样需要确保规章制度的合法性和合理性。
- 公司未支付工资或未足额支付工资：如果公司未按照劳动合同约定或国家规定支付劳动者工资，或者未足额支付劳动者工资，劳动者有权要求公司支付工资差额或解除劳动合同并要求经济补偿。
行动建议：
- 劳动者：如果认为公司扣发工资的行为不合法，可以先与公司协商解决；协商不成的，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 公司：应确保规章制度的合法性和合理性，并明确告知劳动者；在扣发工资时，应按照规章制度的规定进行，并保留好相关证据。
法律后果：
- 如果公司扣发工资的行为被认定为不合法，可能需要向劳动者支付工资差额、经济补偿金等，并可能面临劳动监察部门的处罚。
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