请假公司扣工资是否合法，需根据请假类型、公司规章制度以及相关法律法规综合判断。以下是对此问题的详细分析：
合法情况
事假扣工资：
- 法律依据：根据《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》，职工因个人原因请事假，企业有权不支付其事假期间的工资。这是因为事假属于员工个人原因导致的非正常出勤，企业无需承担该时段的薪酬支付义务。
- 计算方式：事假扣款通常按照“月工资÷21.75×请假天数”来计算，其中21.75为劳动法规定的月计薪天数。这一计算方式确保了扣款的合理性及透明度。
- 注意事项：企业应确保事假扣薪的相关规定经过民主程序制定，并向员工公示告知。同时，扣款不得无故或过度，应确保员工的基本工资或当地最低工资标准得到保障。
病假扣工资（在合法范围内）：
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，职工患病或非因工负伤治疗期间，企业应按有关规定支付其病假工资或疾病救济费。病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。
- 注意事项：若企业按照法定标准扣减病假工资，则是合法的。但若扣减低于法定标准，或未依法制定并公示相关规章制度，则可能构成违法。
请假影响工作绩效时的绩效工资扣减：
- 合法情形：当员工请假导致其无法完成既定的工作任务或目标，进而对整体绩效产生实质性影响时，单位可以依据绩效评估体系扣减绩效工资。但这种扣减必须是基于客观、公正的绩效评估结果，并且扣除的金额和方式应合理。
- 注意事项：扣除的绩效工资应合理，通常不超过劳动者当月工资的一定比例（如20%），且扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。
不合法情况
规章制度未经法定程序或未公示：
- 情形描述：如果单位在制定关于劳动报酬、工作时间等直接涉及劳动者切身利益的规章制度时，未经职工代表大会或全体职工讨论，未与工会或职工代表平等协商确定，或未进行公示或告知劳动者，那么相关扣工资的规定可能无效。
- 后果：员工有权拒绝执行此类规定，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
扣除金额不合理：
- 情形描述：如果扣罚工资的金额过高，导致劳动者的实际工资收入远低于当地最低工资标准，或严重影响劳动者基本生活，这种扣罚可能被认定为不合法。
- 后果：员工有权要求企业补发被扣工资，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
特定假期不得扣工资：
- 情形描述：员工在享受带薪年休假、婚假、产假、陪产假、丧假等法定假期时，单位不得随意以请假为由扣工资。
- 后果：若单位违反此规定，员工有权要求单位补发被扣工资，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
违反劳动合同或集体合同：
- 情形描述：如果劳动合同或集体合同中对请假扣工资有明确的约定，且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么双方应当按照合同的约定来执行。但若单位违反合同约定扣工资，则构成违法。
- 后果：员工有权要求单位按照合同约定支付工资，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
特殊情况与建议
劳动合同或集体合同约定：
- 情形描述：如果劳动合同或集体合同中对请假扣工资有明确的约定，且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么双方应当按照合同的约定来执行。
- 建议：员工在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，了解自己的权利和义务。若对合同条款有疑问，应及时向单位咨询或寻求法律援助。
女职工特殊保护：
- 情形描述：对于女职工在孕期、产期和哺乳期的请假情况，单位应严格遵守法律法规的规定，不得因女职工的怀孕、生育或哺乳而降低其工资水平。
- 建议：女职工在孕期、产期和哺乳期内，应了解自己的特殊权益，并在必要时向单位或劳动监察部门寻求帮助。
总结与建议：请假公司扣工资是否合法，需根据具体情况综合判断。员工在遇到此类问题时，应首先了解自己的请假类型、公司规章制度以及相关法律法规的规定。若认为单位扣工资行为不合法，可与单位协商沟通，要求其按照规定支付工资。若协商不成，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。