在第二次起诉（通常指的是二审程序）中，如果调解未能达成协议，法院会依据案件的具体情况和相关法律规定来作出相应的处理。以下是对这一问题的详细解答：

一、二审调解不成的处理方式

1. 组成合议庭，开庭审理： 在二审程序中，如果调解未能成功，且案件尚未进行二审的法庭审理，法院会依法组成合议庭，并安排开庭审理。这一步骤确保了二审的正式性和公正性，让双方当事人有机会在法庭上充分陈述自己的观点和证据。

2. 及时判决： 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，调解不成的，人民法院应当及时判决。这意味着，在调解未果的情况下，法院不会拖延时间，而是会迅速根据案件事实和适用法律来作出判决。

3. 对一审判决的处理：

   • 维持原判：如果二审法院认为一审判决认定事实清楚，适用法律正确，那么它会以判决方式驳回上诉，维持原判决。
   • 依法改判、撤销或变更：如果一审判决存在事实错误或适用法律不当，二审法院将依法进行改判、撤销或变更原判决。
   • 发回重审：在一审存在严重违反法定程序（如遗漏当事人、违法缺席判决）或特定情况下（如一审未审理的诉讼请求、必须参加诉讼的当事人未参加），二审法院可能裁定撤销原判决，发回原审人民法院重审。但需注意，原审人民法院对发回重审的案件作出判决后，当事人再次提起上诉的，第二审人民法院不得再次发回重审。

4. 对一审裁定的处理： 对于不服一审裁定的上诉案件，二审法院一律使用裁定进行处理。如果原裁定认定事实清楚、适用法律正确，则裁定驳回上诉，维持原裁定；反之，则作出裁定撤销、变更原裁定。

5. 告知另行起诉： 在二审程序中，如果原审原告增加独立的诉讼请求或原审被告提出反诉，且调解不成，二审法院会告知当事人另行起诉。这是为了确保诉讼程序的合法性和正当性，避免因为新增的诉讼请求或反诉而影响整个二审程序的进行。

二、后续流程与注意事项

1. 终审判决： 法院将根据一审及二审的相关证据、法律适用等进行综合评判，作出终审判决。这是二审程序的最终裁决，具有法律效力，双方当事人必须遵守。

2. 当事人配合： 在二审过程中，双方当事人应积极配合法院的工作，包括提交相关证据、按时参加庭审等。这是确保诉讼程序顺利进行的关键，也是维护自身合法权益的重要途径。

3. 上诉期限与程序： 如果对二审判决结果不服，当事人可以在规定的上诉期限内向上一级法院提起上诉。但需注意，上诉有严格的期限和程序要求，逾期或未按程序提起的上诉将不被受理。

4. 强制执行： 如果判决已生效，而一方不履行判决义务，另一方可以向法院申请强制执行。法院将采取相应的执行措施，确保判决得到履行，从而维护当事人的合法权益。

综上所述，第二次起诉（二审）中调解不成时，法院会根据案件的具体情况和法律规定采取相应的处理方式。当事人应充分了解并遵守相关法律程序，以维护自身的合法权益。在整个诉讼过程中保持冷静、理性，积极配合法院的工作，是确保诉讼顺利进行的关键。