在一般用地上（非特定如林地、耕地等有特殊保护规定的用地）建设厂房，要确保合法性，需要遵循一系列法律法规和程序。以下是一个清晰、详细且有深度的指南，帮助您了解如何合法地在一般用地上建设厂房：

一、明确土地性质与规划

1. 核实土地性质：首先，您需要向当地自然资源主管部门查询该土地的性质，确认其是否属于允许进行建设活动的用地类型。
2. 遵守土地利用规划：查询并遵守当地的土地利用总体规划、城乡规划等，确保您的建设活动符合规划要求。

二、申请土地使用权

1. 提交申请：如果土地性质允许建设，您需要向县级以上自然资源主管部门提交土地使用权申请，包括土地使用证（如已有）、变更用途申请书（如适用）、项目可行性研究报告等文件。
2. 获得批准：经过审核，如果您的申请获得批准，您将获得土地使用权，这是建设厂房的基础。

三、办理建设相关证件

1. 建设用地规划许可证：向城乡规划主管部门提交详细的建筑设计方案、环境影响评价报告（如适用）等文件，申请建设用地规划许可证。
2. 建设工程规划许可证：在获得建设用地规划许可证后，提供施工图纸、设计说明等文件至城乡规划主管部门，申请建设工程规划许可证，确保建筑符合当地规划要求和标准。
3. 施工许可证：向住房和城乡建设部门申请办理施工许可证，未取得施工许可证不得擅自开工。

四、环境影响评估与环保措施

1. 环境影响评估：根据《环境影响评价法》，如果厂房建设可能对环境产生影响，您需要编制并提交环境影响评价报告书或报告表。
2. 采取环保措施：根据环境影响评价结果，采取相应的环保措施，确保项目对环境的负面影响得到有效控制，并获得环保部门的审批。

五、缴纳相关费用

根据当地规定，您可能需要缴纳一些与建设活动相关的费用，如森林植被恢复费（如果涉及林地转换）、耕地开垦费（如果涉及耕地转换，但一般用地通常不涉及）等。确保按时缴纳这些费用，以支持相关的生态保护和恢复工作。

六、建设过程与竣工验收

1. 遵守法律法规：在建设过程中，严格遵守土地管理、城乡规划、环境保护等方面的法律法规。
2. 竣工验收：厂房建设完成后，按照相关规定进行竣工验收，确保建筑质量与安全。

七、产权登记

通过竣工验收后，向不动产登记机构申请办理产权登记，取得不动产权证书，确保厂房的合法产权。

总结与建议：

在一般用地上建设厂房是一个涉及多个政府部门和多项法律法规的复杂过程。为确保项目的顺利进行和合法性，我建议您在进行此类建设活动前咨询专业的律师或相关机构，以获得全面的法律指导和支持。同时，您应严格遵守所有法律法规，确保建设活动的合规性和可持续性。