当遇到员工提交的病假材料不合规时，作为公司或人力资源部门，可以采取以下步骤来要求员工进行整改：

一、明确告知员工材料不合规

首先，需要以书面或正式的方式明确告知员工其提交的病假材料存在不合规之处。在告知中，应详细列出哪些材料不符合规定，比如缺少医院证明、病历本、医药费单据，或者病假证明上的信息不完整、不清晰等。同时，要引用公司相关的规章制度，说明这些规定是员工必须遵守的，以确保告知的权威性和有效性。

二、要求员工补充或重新提交合规材料

在告知员工材料不合规后，应明确要求员工在规定的时间内补充或重新提交合规的病假材料。可以设定一个合理的期限，比如3个工作日或5个工作日，让员工有足够的时间去准备和提交。同时，要告知员工，如果逾期未提交或提交的材料仍然不合规，公司将有权按照规章制度进行处理，比如拒绝批准病假、视为旷工等。

三、提供必要的指导和帮助

在员工补充或重新提交材料的过程中，公司可以提供必要的指导和帮助。比如，可以告知员工哪些医院或医生开具的病假证明是公司认可的，或者提供一份病假材料清单，让员工清楚地知道需要准备哪些材料。此外，如果员工对病假制度或材料要求有疑问，公司也应耐心解答，确保员工能够正确理解和遵守相关规定。

四、加强后续监控和审核

在员工提交了合规的病假材料后，公司还应加强后续的监控和审核工作。比如，可以定期探访生病员工，了解他们的病情和休养情况，确保病假期间的活动与医嘱休养要求相符。同时，也可以对员工的病假证明进行复核，比如通过电话联系医生或医院进行核实，以确保病假的真实性。

五、依据规章制度进行处理

如果员工在整改过程中仍然存在不配合或弄虚作假的行为，公司应依据规章制度进行处理。比如，可以视为员工严重违反公司制度，根据公司规定给予相应的处罚，甚至解除劳动合同。在处理过程中，公司应确保程序的合法性和合规性，比如事先通知工会、保留相关证据等。

六、加强制度宣传和培训

为了避免类似情况的再次发生，公司还应加强病假制度的宣传和培训工作。可以通过内部培训、公告栏、员工手册等方式，让员工清楚地了解病假制度的相关规定和要求。同时，也可以定期组织员工进行制度学习和考核，确保员工能够严格遵守和执行相关规定。

综上所述，当遇到员工提交的病假材料不合规时，公司应明确告知、要求整改、提供指导、加强监控、依据制度处理，并加强制度宣传和培训。通过这些措施的实施，可以确保病假制度的严格执行和公司的正常运营。