针对您提出的“利用职务之便侵占公司5000以上财产怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、法律定性
根据《中华人民共和国刑法》第二百七十一条的规定，职务侵占罪是指公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，且数额较大的行为。然而，“数额较大”的具体标准通常由各地司法解释来确定。在多数地区，职务侵占罪的“数额较大”起点通常高于5000元，因此，5000元的侵占金额在多数情况下尚未达到刑事立案标准，不构成职务侵占罪。但这并不意味着该行为合法，它仍然属于违法行为，可能面临行政处罚或民事赔偿。
二、处理方式
刑事责任：
- 由于金额未达刑事立案标准，行为人通常不会被追究刑事责任。
- 但若存在多次侵占、手段恶劣或其他严重情节，司法机关可能会综合判断后追究责任，不过这种情况较为罕见。
行政处罚：
- 根据《中华人民共和国治安管理处罚法》第四十九条，对于盗窃、诈骗、哄抢、抢夺、敲诈勒索或故意损毁公私财物的行为，可处五日以上十日以下拘留，并可并处五百元以下罚款；情节较重的，处十日以上十五日以下拘留，并可并处一千元以下罚款。虽然职务侵占与盗窃性质不同，但在实际执法中，可能会参照类似条款对职务侵占行为进行治安处罚。
- 同时，用人单位也可以依据内部规章制度给予行为人警告、记过、开除等纪律处分。
民事责任：
- 行为人需要退还侵占的5000元及可能产生的孳息（如利息）。
- 若侵占行为导致公司其他经济损失（如追讨费用、业务损失等），行为人还需承担相应的赔偿责任。
三、建议措施
主动退赔：
- 行为人应尽快归还侵占的款项，以减轻或避免可能的法律后果。
协商和解：
- 行为人可以与公司进行沟通，尝试达成和解或调解协议，以避免纠纷升级。
法律咨询：
- 在处理此类问题时，行为人或公司都可以聘请专业律师进行法律咨询，以评估风险并制定应对策略。
完善制度：
- 公司应借此机会完善内部财务和内控制度，加强员工培训，提高法律意识和职业道德水平，以预防类似事件再次发生。
四、典型案例参考
- 某公司员工侵占公款5000元，因金额未达刑事立案标准，被公安机关处以行政拘留并罚款，同时被公司解除劳动合同。
- 另一员工侵占金额超过当地立案标准，被依法追究刑事责任，判处有期徒刑并处罚金。
综上所述，利用职务之便侵占公司5000元以上财产虽不构成职务侵占罪，但仍需依法处理。公司应通过内部调查、沟通、法律手段以及完善内控制度等多方面措施来有效应对并预防此类事件的发生。同时，行为人也应认识到自己的错误，主动退赔并承担相应的法律责任。