当发现公司法人利用职务便利侵占公司财产时，这是一个严重的违法行为，不仅损害了公司的利益，也可能对股东和其他利益相关者造成损失。针对这一问题，以下是一套详细且有条理的处理方案：
一、明确侵占行为及法律后果
首先，需要明确公司法人的侵占行为，这通常包括利用职务之便，将公司财物非法占为己有，如挪用资金、私分资产、虚构交易套取现金等。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，这种行为可能构成职务侵占罪，将面临五年以下有期徒刑或者拘役的处罚；若数额巨大，则可能处五年以上有期徒刑，并可以并处没收财产。
二、采取应对措施
证据收集
- 这是后续所有行动的基础，必须确保证据的合法性、有效性和充分性。
- 收集内容包括公司的财务账目、交易记录、合同文件、电子邮件、聊天记录等，特别是能证明资金非法流转的记录。
- 可以通过内部审计、查阅相关文件、询问知情人员等方式进行收集，必要时可寻求专业律师或会计师的协助。
内部处理
- 尝试与公司法人进行内部沟通，指出其侵占行为的不当性，并要求归还财物。同时，明确告知法律后果，敦促其主动纠正。
- 若沟通无果，可依据公司章程召开监事会、董事会或股东会，讨论并采取相应决议，如要求法人停止侵占、归还财物、纪律处分或罢免职务等。
行政举报
- 向工商行政管理部门、税务部门等相关机构举报法人的侵占行为，提供详细证据和情况说明，以便相关部门进行调查和处理。
刑事报案
- 若法人侵占行为数额较大，可能构成职务侵占罪，此时应向公安机关经侦部门报案，提供充分证据，并配合司法机关的工作，等待调查结果。
- 在报案过程中，可寻求专业律师的协助，以确保报案材料的准确性和完整性。
民事诉讼
- 公司可向法院提起民事诉讼，要求法人返还侵占的财物并赔偿损失。在诉讼中，公司需承担举证责任，提供充分证据证明其主张。
- 若公司胜诉而法人不履行判决义务，可向法院申请强制执行，通过法律手段追回被侵占的财物和获得赔偿。
三、预防机制建设
为了避免类似事件再次发生，公司应加强内部防控机制的建设：
完善治理结构
- 建立独立监事制度，强化董事会监督职能，确保公司决策的透明度和公正性。
- 实施高管轮岗制度，避免权力过度集中，减少侵占行为的发生机会。
健全财务制度
- 实行收支两条线管理，严格审批流程，确保公司资金的合理使用和安全。
- 定期聘请第三方机构进行财务审计，及时发现和纠正潜在的财务问题。
加强合规培训
- 组织法律风险防范专题培训，提升全员合规意识，使员工了解并遵守相关法律法规和公司规章制度。
- 建立匿名举报奖励机制，鼓励员工参与监督，及时发现和报告潜在的侵占行为。
技术防控手段
- 部署财务监控系统，实时监测异常资金流向，及时发现和阻止侵占行为。
- 运用区块链技术实现关键数据不可篡改存储，确保公司财务数据的真实性和完整性。
综上所述，面对公司法人的侵占行为，公司应迅速采取行动，通过多渠道依法追究其责任，并追回被侵占的财产。同时，加强公司内部防控机制的建设，确保公司的长期稳健发展。在整个过程中，证据的收集和保存至关重要，它是后续所有法律行动的基础和关键。