当同一单位的车辆发生碰撞事故时，赔偿责任的确定及流程可以归纳为以下几个关键步骤，我会结合相关法律条款为您详细解释：
一、明确事故责任主体
交通事故责任认定：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条，公安机关交通管理部门会根据事故现场勘查、证人证言等证据，划分事故责任。若单位车辆驾驶员负全部或主要责任，则单位作为车辆所有人或使用人需承担相应的赔偿责任。
职务行为的判定：
- 如果驾驶员是在执行工作任务（如送货、公务出行等）过程中发生的事故，依据《民法典》第一千一百九十一条，用人单位应承担侵权责任。这意味着，无论驾驶员是否存在故意或重大过失，单位都需要先行赔付。
二、确定赔偿义务方
交强险优先赔付：
- 单位车辆必须投保机动车交通事故责任强制保险（交强险）。根据《道路交通安全法》第七十六条，保险公司会在规定的限额内进行赔偿，包括死亡伤残赔偿限额18万元、医疗费用赔偿限额1.8万元、财产损失赔偿限额0.2万元。
商业三者险补充赔偿：
- 如果交强险的赔偿限额不足以覆盖事故造成的损失，且单位购买了商业第三者责任险，那么保险公司会按照合同约定赔付剩余部分。但需要注意的是，保险合同中的免赔条款可能会影响实际赔偿金额。
单位直接赔偿责任：
- 在以下情形中，单位需要自行承担超出保险范围的赔偿：未购买足额商业保险、存在保险拒赔事由（如酒驾、无证驾驶等）、精神损害抚慰金等保险不覆盖的费用。
三、具体索赔流程
证据收集阶段：
- 保存交警部门出具的事故认定书，这是确定事故责任的重要依据。
- 获取医疗诊断证明、费用清单，以证明您的医疗费用支出。
- 记录误工时间、收入减少证明，以计算您的误工损失。
- 收集护理费、营养费等相关凭证，以证明您的其他合理支出。
协商调解程序：
- 您可以与单位及保险公司进行三方协商，尝试达成赔偿协议。
- 如果协商不成，可以申请交警部门主持调解，或者向人民调解委员会申请调解。
诉讼维权途径：
- 如果协商和调解均未果，您可以在事发地或被告住所地法院提起民事诉讼，通过法律途径维护自己的权益。需要注意的是，诉讼时效为三年，自您知道权利受损之日起计算。
四、特殊情形处理
- 驾驶员存在重大过失：如果驾驶员在事故中存在重大过失，单位在赔偿后有权向驾驶员追偿。
- 车辆挂靠经营：如果车辆是挂靠经营的情况，被挂靠单位与挂靠人需要承担连带责任。
- 未投保交强险：如果单位未投保交强险，那么单位需要在交强险限额内先行赔付。
综上所述，同一单位车辆发生碰撞事故时，赔偿责任的确定及流程涉及多个方面。建议您在处理此类事故时，及时收集证据、与单位及保险公司沟通协商，并在必要时寻求法律帮助以维护自己的合法权益。