员工涉嫌犯罪时，用人单位能否解除劳动合同需视具体情况而定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、员工被依法追究刑事责任的情况
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条第六项规定，劳动者被依法追究刑事责任的，用人单位可以解除劳动合同。
具体解释：
- “被依法追究刑事责任”包括被人民法院判处刑罚（如管制、拘役、有期徒刑、无期徒刑、死刑等主刑，以及罚金、剥夺政治权利、没收财产等附加刑），或者被人民法院依据刑法相关规定免予刑事处分（如依据《刑法》第三十七条免予刑事处罚）。
操作建议：
- 在此情况下，用人单位可以依法解除劳动合同，但应确保解除程序的合法性，如提前通知工会（如有工会组织）、向劳动者送达解除劳动合同的书面通知等。
二、员工仅涉嫌犯罪，尚未被依法追究刑事责任的情况
法律依据：
- 在员工仅是涉嫌违法犯罪，而未经人民法院依法判决确定有罪之前，其合法权益应受到保护。用人单位不能仅凭涉嫌犯罪就擅自解除劳动合同。
特殊处理：
- 对工作造成重大影响：若员工涉嫌犯罪的行为对单位工作秩序、商业信誉等造成重大负面影响，且单位规章制度有明确规定，单位可根据规章制度对劳动者进行停职、调整工作岗位等处理，但解除劳动合同需谨慎，并需有充分合理的依据。
- 被依法限制人身自由：若员工涉嫌违法犯罪被有关机关收容审查、拘留或逮捕，单位可与其暂时停止劳动合同的履行，但不承担劳动合同规定的相应义务。若员工经证明被错误限制人身自由，其损失可由其依据《国家赔偿法》要求有关部门赔偿。
操作建议：
- 在此情况下，用人单位应谨慎处理，不得擅自解除劳动合同。可以等待法律程序的最终结果，或者根据单位规章制度和实际情况采取其他合理措施。
三、劳动合同约定及单位规章制度的影响
劳动合同约定：
- 若劳动合同中有特别约定，如员工涉嫌犯罪时用人单位有权解除劳动合同等条款，且这些约定不违反法律法规，那么用人单位可按照约定处理。
单位规章制度：
- 若用人单位的规章制度中有相关规定，如员工不得参与违法犯罪活动等，且这些规定不违反法律法规，那么在员工涉嫌刑事犯罪时，用人单位可按照规定进行处理。但同样需要谨慎操作，确保解除劳动合同的合法性和合理性。
四、注意事项
确认犯罪事实和责任：
- 用人单位在解除劳动合同前，必须准确核实员工确实被依法追究刑事责任或严重违反了规章制度，不能仅凭传闻或初步调查结论就贸然行动。
履行法定程序：
- 解除劳动合同的决定应按照单位规章制度规定的程序进行，并通常需要通知工会（如果有工会组织），听取工会的意见，以确保解除程序的合法合规性。
书面通知员工：
- 应以书面形式正式通知员工解除劳动合同的决定，明确解除的原因，并告知员工享有的相关权利以及后续手续的办理事宜。
经济补偿问题：
- 若用人单位合法解除劳动合同，可能需要按照劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付经济补偿。但若用人单位违法解除劳动合同，劳动者则有权主张赔偿金，赔偿金的标准通常为经济补偿标准的二倍。
总结与建议：在处理员工涉嫌刑事犯罪的问题时，用人单位应谨慎行事，确保遵守相关法律法规和程序。首先，要明确区分“涉嫌”与“被依法追究刑事责任”的不同法律后果；其次，在决定解除劳动合同前，应仔细审查劳动合同和单位规章制度中的相关条款；最后，务必遵循法定的解除程序，以避免潜在的法律风险。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。