结论：车祸当时司机未构成交通肇事罪，但伤者3年后死亡，司机是否需要承担刑事责任，这主要取决于伤者死亡与车祸之间的因果关系、司机在车祸中的责任以及是否存在其他违法犯罪行为。以下是对此问题的详细分析：
一、因果关系与责任认定
直接因果关系：
- 如果伤者的死亡是由于车祸直接导致的，且这种因果关系在医学和法律上能够得到确认，那么司机可能需要承担刑事责任。这通常要求伤者的死亡与车祸之间存在直接的、必然的联系，如重伤后未得到及时救治或救治无效死亡等。
间接因果关系或中断：
- 如果伤者的死亡与车祸之间的因果关系被其他因素中断或减弱，如伤者在车祸后得到了及时救治，但因其他疾病或意外事件导致死亡，那么司机可能不需要承担刑事责任。这种情况下，需要详细分析伤者死亡的具体原因，以及车祸在其中所起的作用。
二、司机在车祸中的责任
主要或全部责任：
- 如果司机在车祸中负有主要或全部责任，且伤者的死亡与车祸存在直接因果关系，那么司机可能构成交通肇事罪，需要承担刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》第一百三十三条的规定，违反交通运输管理法规，因而发生重大事故，致人重伤、死亡或者使公私财产遭受重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役。
次要责任或无责任：
- 如果司机在车祸中仅负有次要责任或无责任，且伤者的死亡与车祸之间的因果关系不明确或已被其他因素中断，那么司机通常不需要承担刑事责任。但司机仍需根据其在车祸中的责任比例，承担相应的民事赔偿责任。
三、其他违法犯罪行为
逃逸行为：
- 如果司机在车祸后逃逸，无论伤者的死亡与车祸之间的因果关系如何，司机都可能面临更严厉的刑事处罚。根据《中华人民共和国刑法》第一百三十三条的规定，交通运输肇事后逃逸或者有其他特别恶劣情节的，处三年以上七年以下有期徒刑；因逃逸致人死亡的，处七年以上有期徒刑。
其他违法行为：
- 如果司机在车祸中存在其他违法行为，如酒驾、毒驾、无证驾驶等，这些行为将增加司机承担刑事责任的可能性。即使伤者的死亡与车祸之间的因果关系不明确，司机也可能因这些违法行为而受到刑事处罚。
四、特殊情形下的责任认定
意外事件：
- 如果车祸是由于不可预见、不可避免的原因造成的，如突发疾病、车辆故障等，且司机没有过错，那么属于意外事件，司机不构成犯罪，不需要承担刑事责任。
医疗过错：
- 如果伤者的死亡是由于医疗机构的过错导致的，如误诊、误治等，那么司机可能不需要承担刑事责任。但这种情况下，需要详细分析医疗过错与伤者死亡之间的因果关系，以及司机在车祸中的责任比例。
建议：在处理此类案件时，建议司机及时咨询专业律师，以便更准确地评估自己的法律责任和风险。同时，司机也应积极配合相关部门的调查和处理工作，如实陈述事故经过和自身情况，以便相关部门能够做出公正、合理的裁决。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。