结论前置：侵占行为退还财物后，是否还会立案取决于多个因素，包括侵占的数额、情节严重程度以及被害人的意愿等。一般来说，如果侵占数额较大或情节严重，即使退还了财物，仍有可能被立案处理；但如果情节显著轻微且危害不大，或者双方达成了刑事和解，则可能不会被立案。
详细分析：
一、法律规定层面
根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，侵占罪是指以非法占有为目的，将他人的交给自己保管的财物、遗忘物或者埋藏物非法占为己有，数额较大，拒不交还的行为。对于侵占罪，一旦数额达到刑事立案标准，即构成犯罪。退还财物虽然表现出了一定的悔罪态度，但并不能改变犯罪行为的已经成立。因此，从法律条文来看，退还财物并不影响对犯罪行为的定性判断，也不必然导致不立案。
二、实际司法考量层面
数额与情节：
- 如果侵占的数额较大或情节严重，如多次侵占、侵占特定款物（如救灾抢险资金）等，即使行为人退还了财物，司法机关仍会依法立案处理。因为这类行为对被害人权益和社会秩序造成了严重破坏，具有较大的社会危害性。
- 如果侵占的数额较小、情节显著轻微，且行为人及时退还了财物，并取得了被害人的谅解，同时未给被害人造成其他严重后果，司法机关可能会根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，认为情节显著轻微、危害不大，从而不予立案。
被害人意愿：
- 被害人的意愿也是影响是否立案的重要因素。如果被害人坚持追究行为人的刑事责任，即使行为人退还了财物，司法机关仍可能会立案处理。
- 反之，如果被害人愿意谅解行为人，并明确表示不追究其刑事责任，司法机关在综合考虑案件情况后，有可能作出不立案或不起诉等从宽处理决定。
刑事和解：
- 在部分轻微的侵占案件中，如果行为人与被害人达成刑事和解协议，积极退赃退赔、赔偿损失、赔礼道歉，并且被害人明确表示谅解，司法机关有可能综合考虑案件情况，作出不立案或不起诉等从宽处理决定。但需要注意的是，刑事和解并不适用于所有侵占案件，特别是那些数额巨大或情节严重的案件。
三、建议与警示
- 不要抱有侥幸心理：侵占是严重的违法行为，一旦实施就可能面临法律制裁。退还财物并不能完全消除犯罪行为的后果，只是可能作为从轻处罚的情节被考虑。
- 积极配合调查：如果涉及侵占行为，应尽快向公安机关自首，并积极配合调查。这样有助于争取从轻处理，并减少不必要的法律风险。
- 加强法律意识：无论是个人还是企业，都应加强法律意识，遵守法律法规，不触碰法律的底线。对于个人而言，应树立正确的价值观和职业道德观；对于企业而言，应建立健全的内部管理制度和监督机制，预防侵占行为的发生。
举例说明：
- 假设某人侵占了公司财物10万元，并在案发后及时退还了全部款项，同时取得了公司的谅解。但由于侵占数额较大，司法机关仍可能会依法立案处理，但在量刑时会考虑其退还财物和取得谅解的情节，从而可能从轻处罚。
- 假设某人侵占了朋友财物5000元，并在案发后立即退还了款项，同时取得了朋友的谅解。由于侵占数额较小、情节显著轻微，且未给朋友造成其他严重后果，司法机关可能会认为情节显著轻微、危害不大，从而不予立案。
总结：侵占行为退还财物后是否还会立案，取决于多个因素的综合考量。如果你或你身边的人涉及此类问题，建议直接向我咨询，以便根据具体情况给出更准确的法律建议。