结论：单位个人档案袋里的刑事判决书被偷偷毁掉后，将来办理退休时是否能查出来，这取决于多个因素，但一般情况下，相关部门在办理退休时是有可能通过合法途径查询到个人的刑事判决记录的。
分析说明：
刑事判决记录的保存与查询：
- 刑事判决记录是司法机关对犯罪行为作出的正式法律文书，具有法律效力，且通常会被长期保存。
- 在办理退休等涉及个人身份和背景审查的事项时，相关部门（如社保局、人事局等）有权根据法律法规的规定，通过合法途径查询个人的刑事判决记录。
档案袋被毁的影响：
- 如果单位个人档案袋里的刑事判决书被偷偷毁掉，这并不意味着该记录就不存在了。因为刑事判决记录通常还会保存在司法机关的档案中。
- 档案袋的毁损可能只是使得单位内部无法直接获取该记录，但并不影响相关部门通过其他合法途径进行查询。
办理退休时的审查流程：
- 在办理退休时，相关部门通常会进行一系列的审查，包括个人身份、工作经历、社保缴纳情况等。
- 在某些情况下，特别是涉及公职人员或特定职业的退休审查时，相关部门可能会更加严格地审查个人的背景，包括是否有刑事犯罪记录。
可能的法律后果：
- 如果个人故意毁损档案袋中的刑事判决书，并试图隐瞒自己的刑事犯罪记录，这可能构成违法行为，如伪造、隐匿、毁灭证据等。
- 一旦被发现，个人可能会面临法律责任，包括但不限于行政处罚、刑事处罚等。同时，这也可能影响个人的退休待遇和声誉。
建议与行动：
- 如实申报：在办理退休时，应如实申报个人的刑事犯罪记录（如果有的话）。隐瞒或虚假申报可能导致严重的法律后果。
- 咨询相关部门：如果不确定自己的刑事判决记录是否会被查询到，或者对退休审查流程有疑问，可以咨询相关部门（如社保局、人事局等）或寻求专业律师的帮助。
- 保护个人档案：个人应妥善保管自己的档案材料，避免被他人毁损或篡改。如果发现档案材料被毁损或篡改，应及时向相关部门报告并寻求帮助。
进一步思考：
- 在数字化时代，个人信息的保存和查询变得更加便捷。因此，即使档案袋中的刑事判决书被毁掉，相关部门也可能通过电子档案或其他合法途径查询到该记录。
- 个人应增强法律意识，了解自己的权利和义务。在面对涉及个人身份和背景审查的事项时，应积极配合相关部门的工作，并如实提供相关信息。
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