公司通过微信打卡的方式发放工资，本身并不直接构成违法，但这种方式可能存在一些潜在的法律风险和问题，需要具体分析。以下从不同角度为你详细阐述：

1. 工资支付方式的合法性：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。微信打卡发放工资，如果实际上是以货币形式（如微信转账）支付，且能够确保工资的准确、及时支付，并不直接违反法律规定。
   • 然而，关键在于这种支付方式是否能够满足工资支付的“明确性”和“可追溯性”要求。微信打卡可能缺乏正式的工资条或支付记录，这在未来可能引发关于工资支付情况的争议。

2. 工资支付记录的保留：

   • 法律规定，用人单位应当书面记录支付劳动者工资的数额、时间、领取者的姓名以及签字，并保存两年以上备查。微信打卡方式可能难以满足这一要求，因为微信聊天记录可能容易被删除或丢失，且不一定包含所有必要的支付信息。
   • 如果公司无法提供完整的工资支付记录，可能在劳动争议中处于不利地位，甚至可能面临劳动行政部门的处罚。

3. 税务合规性：

   • 工资支付涉及个人所得税的代扣代缴。公司通过微信打卡发放工资，需要确保税务处理的合规性，包括正确计算和代扣代缴个人所得税。
   • 如果公司未能正确履行税务义务，可能面临税务机关的处罚，包括罚款、滞纳金等。

4. 劳动者权益保护：

   • 微信打卡方式可能缺乏正式的工资支付流程，这可能影响劳动者对工资支付的知情权和监督权。
   • 在发生工资争议时，劳动者可能难以提供有效的证据来维护自己的权益。

建议：

• 对于公司而言，为了降低法律风险，建议采用更正式、更可追溯的工资支付方式，如银行转账，并保留完整的工资支付记录。
• 如果公司确实希望采用微信打卡等方式发放工资，应确保这种方式能够满足法律要求，包括提供完整的工资支付记录、确保税务合规性等。
• 对于劳动者而言，如果公司采用微信打卡等方式发放工资，应要求公司提供完整的工资支付记录，并保留好自己的相关证据，以备不时之需。

如果你在公司工资支付方面遇到任何问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。