夫妻分别在监督部门与被监督部门上班，这一行为本身并不直接违反法律法规，但是否合法需结合具体情况来判断。以下是从不同角度进行的分析：

1. 法律法规层面：

   • 目前，我国并没有明确的法律法规禁止夫妻双方分别在监督部门与被监督部门工作。这类情况主要涉及到的是工作关系的独立性以及可能存在的利益冲突问题，而非直接的违法性。

2. 利益冲突与回避原则：

   • 在实际操作中，如果夫妻双方分别在监督部门与被监督部门工作，且存在直接的监督与被监督关系，那么可能会引发利益冲突的问题。例如，一方可能因私人关系而影响监督的公正性，或者被监督方可能因夫妻关系而获得不正当的便利。
   • 为了避免这种情况，许多单位或组织会制定内部规章制度，要求存在潜在利益冲突的员工进行回避或调整工作岗位。这是基于公平、公正和透明的原则，以确保工作的正常进行和组织的健康发展。

3. 实际操作建议：

   • 如果夫妻双方确实面临这种情况，建议首先咨询所在单位或组织的人事部门或相关负责人，了解是否有相关的规章制度或政策要求。
   • 如果存在潜在的利益冲突，且单位或组织有明确的回避要求，那么夫妻双方应积极配合，按照要求进行调整工作岗位或采取其他必要的措施。
   • 如果没有明确的规章制度或政策要求，但夫妻双方认为存在潜在的利益冲突或可能影响工作的公正性，也可以主动向单位或组织提出调整工作岗位的申请，以维护工作的正常进行和组织的声誉。

总结来说，夫妻分别在监督部门与被监督部门上班并不直接违法，但需关注是否存在利益冲突以及单位或组织的内部规章制度。如有潜在利益冲突或单位有明确要求，应积极配合调整工作岗位或采取其他必要措施。如果你或你身边的人遇到类似情况，并对此有进一步的疑问或需要具体的法律建议，可以直接向我咨询。