结论：司机是否需要处理老板指定路线导致的抓拍问题，需分情况讨论，主要取决于抓拍类型、司机与老板之间的法律关系以及是否存在过错等因素。以下为具体分析：
若抓拍为交通违章抓拍
- 司机与老板为雇佣关系：根据《民法典》第一千一百九十二条，个人之间形成劳务关系，提供劳务一方因劳务造成他人损害的，由接受劳务一方承担侵权责任。因此，若司机是在执行老板指定的工作任务过程中因违章被抓拍，通常情况下应由老板承担违章责任，司机无需自行处理。但若司机存在故意或重大过失（如明知违章仍故意为之），老板在承担责任后有权向司机追偿。
- 司机与老板为劳动关系：依据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若司机因执行工作任务违章，一般应由用人单位（老板）承担责任，除非司机存在故意或重大过失。
若抓拍为非法营运抓拍
- 若司机驾驶的车辆未取得营运资质，或司机本人未取得相应从业资格，而被交通执法部门抓拍到非法营运行为，此时司机和老板均可能面临行政处罚。根据《中华人民共和国道路运输条例》第六十三条，未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输经营的，由县级以上地方人民政府交通运输主管部门责令停止经营，并处罚款。司机作为直接实施非法营运行为的人员，老板作为指使或默许非法营运的一方，均需承担相应法律责任，司机不能仅因老板指定路线而免责。
司机应对建议
- 保留证据：司机应保留与老板关于指定路线的沟通记录（如微信聊天记录、通话录音等），以及执行工作任务的相关证据（如工作安排表、出车记录等），以证明自己是在执行老板的指令。
- 与老板沟通：在收到抓拍通知后，司机应及时与老板沟通，说明情况，并要求老板按照法律规定承担相应责任。若老板拒绝承担责任，司机可向相关部门（如交通管理部门、劳动监察部门等）投诉或举报。
- 寻求法律帮助：若司机与老板之间就责任承担问题无法达成一致，或司机因此遭受了经济损失（如被扣分、罚款等），司机可向我咨询，我会根据具体情况为司机提供法律建议和帮助。