结论：故意伤害轻伤二级酌定不起诉后，可以进行行政罚款和警告，但需满足一定条件并遵循法定程序。以下从法律适用、程序衔接、实务操作三个角度展开分析：

一、法律适用：行政处罚与刑事不起诉的独立性

1. 刑事不起诉不排斥行政责任
   根据《刑事诉讼法》第177条，酌定不起诉（相对不起诉）适用于犯罪情节轻微、依照刑法不需判处刑罚或免除刑罚的情形。此时，行为人虽免于刑事处罚，但行政责任仍可能存在。
   法律依据：

   • 《行政处罚法》第35条明确，违法行为构成犯罪，人民法院判处拘役或者有期徒刑时，行政机关已给予当事人行政拘留的，应当依法折抵相应刑期；违法行为构成犯罪，人民法院判处罚金时，行政机关已给予当事人罚款的，应当折抵相应罚金。但该条未禁止刑事程序终结后单独追究行政责任。
     
   • 《治安管理处罚法》第95条第2款规定，对依法不予刑事处罚的，必要时可以予以行政处罚，为酌定不起诉后行政处罚提供了直接依据。

2. 故意伤害轻伤二级的行政处罚依据
   根据《治安管理处罚法》第43条，殴打他人或故意伤害他人身体的，处5-10日拘留，并处200-500元罚款；情节较轻的，处5日以下拘留或500元以下罚款。轻伤二级虽已达到刑事立案标准，但若刑事程序终结后仍需追究行政责任，公安机关可依据该条款作出处罚。

二、程序衔接：刑事与行政程序的转换规则

1. “一事不再罚”原则的适用边界
   该原则要求对同一违法行为不得给予两次相同性质的处罚，但刑事处罚与行政处罚性质不同，故不适用此原则。例如，行为人因故意伤害被酌定不起诉后，公安机关可对其处以罚款或警告，不违反“一事不再罚”。

2. 行政处罚的启动条件

   • 刑事程序终结：需以检察机关作出酌定不起诉决定为前提，此时刑事追责程序已终止。
     
   • 行政违法性仍存在：需证明行为人除构成犯罪外，还违反了《治安管理处罚法》等行政法规（如存在未被刑事评价的情节，如多次殴打、持械等）。
     
   • 必要性审查：根据《治安管理处罚法》第95条第2款，行政处罚需以“必要”为前提，通常需结合行为社会危害性、行为人主观恶性等因素综合判断。

三、实务操作：行政处罚的具体形式与限制

1. 行政罚款与警告的适用情形

   • 罚款：适用于违法行为具有一定社会危害性，但情节较轻的情形。例如，行为人虽造成轻伤二级，但具有自首、赔偿谅解等情节，检察机关作出酌定不起诉后，公安机关可对其处以500元以下罚款。
     
   • 警告：适用于违法行为轻微，社会危害性较小的情形。例如，行为人因邻里纠纷引发冲突，造成轻伤二级，但系初犯且已积极赔偿，公安机关可对其予以警告。

2. 行政处罚的幅度限制

   • 罚款上限：根据《治安管理处罚法》第43条，故意伤害他人身体的罚款上限为500元，但若存在“结伙殴打、伤害他人”“殴打残疾人、孕妇”等加重情节，罚款上限可提升至1000元（但刑事不起诉后通常不适用加重情节）。
     
   • 警告的独立性：警告可单独适用，也可与罚款并处，但需符合“过罚相当”原则，避免处罚过重。

四、风险提示：行政处罚的救济途径

若行为人对行政处罚不服，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。例如，若认为公安机关处罚决定证据不足、程序违法或幅度不当，可在收到处罚决定书后60日内申请复议，或6个月内直接向法院起诉。

总结：故意伤害轻伤二级酌定不起诉后，公安机关可依法对行为人处以行政罚款或警告，但需满足行政违法性存在、程序合法、处罚必要等条件。实务中需结合具体情节判断处罚形式与幅度，确保“过罚相当”。如有进一步疑问，可直接向我咨询。