工厂上班打卡扣钱是否合法，需分情况讨论：
若工厂规章制度明确且合法，打卡扣钱作为合理的管理措施：
- 合法情形：如果工厂的规章制度中明确规定了考勤制度，包括打卡要求以及未打卡或迟到、早退的相应处理措施，并且这些规章制度是经过民主程序制定（如职工代表大会讨论通过）、公示或告知员工的，那么工厂按照规章制度对未打卡或违反考勤制度的员工进行扣钱，通常是合法的。这种扣钱行为被视为工厂对员工违反劳动纪律的一种合理管理措施，旨在维护正常的生产秩序和工作效率。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
若工厂规章制度不合法或未公示，打卡扣钱则可能不合法：
- 不合法情形：如果工厂的规章制度未经民主程序制定、未公示或告知员工，或者规章制度中的扣钱规定违反了法律法规的强制性规定（如扣钱金额过高、扣钱理由不合理等），那么工厂对员工进行打卡扣钱的行为可能是不合法的。在这种情况下，员工有权拒绝接受不合理的扣钱，并可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
- 风险提示：工厂在制定和执行考勤制度时，应确保规章制度的合法性和合理性，避免侵犯员工的合法权益。同时，员工也应了解自己的权利和义务，积极维护自己的合法权益。
建议与行动指南：
- 对工厂：建议工厂在制定和执行考勤制度时，确保规章制度的合法性和合理性，并经过民主程序制定、公示或告知员工。同时，应合理设置扣钱标准和程序，避免过度扣钱或侵犯员工权益。
- 对员工：如果员工认为工厂的打卡扣钱行为不合法或不合理，可以先与工厂进行沟通协商，寻求解决方案。如果沟通无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在投诉或申请仲裁时，员工应提供相关证据（如规章制度、考勤记录、工资条等）来支持自己的主张。
总结：工厂上班打卡扣钱是否合法，取决于工厂的规章制度是否合法、合理以及是否经过民主程序制定、公示或告知员工。如果工厂的规章制度合法且合理，那么打卡扣钱通常是合法的；反之，则可能不合法。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。