员工偷公司一千二百元东西，公司可依据内部规章制度和法律规定进行处理，具体如下：

1. 内部处理：

   • 调查核实：公司应首先进行内部调查，核实员工偷窃的事实，包括收集相关证据，如监控录像、证人证言等，确保事实清楚、证据确凿。
   • 依据规章制度：根据公司内部规章制度，对偷窃员工进行相应处理。规章制度中应明确规定偷窃行为的处罚措施，如警告、罚款、解除劳动合同等。一千二百元虽未达到刑事立案标准，但已构成对公司财产的侵害，公司有权依据规章制度进行严肃处理。
   • 通知工会：若公司决定解除与该员工的劳动合同，应事先将理由通知工会。工会认为不适当的，有权提出意见。公司应研究工会的意见，并将处理结果书面通知工会。

2. 法律处理：

   • 民事赔偿：公司有权要求偷窃员工赔偿因偷窃行为给公司造成的损失，包括直接损失和间接损失。公司可以通过协商、调解或诉讼等方式要求员工赔偿。
   • 行政处罚：虽然一千二百元的偷窃行为不构成刑事犯罪，但公司可以向公安机关报案，由公安机关根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的规定，对偷窃员工进行行政处罚，如罚款、拘留等。
   • 刑事责任（若情节严重或数额累积）：虽然单次偷窃一千二百元不构成盗窃罪的刑事立案标准，但如果员工多次偷窃或偷窃数额累积达到刑事立案标准，公司将有权向公安机关报案，追究员工的刑事责任。

3. 预防措施：

   • 加强安保：公司应加强安保措施，如安装监控摄像头、加强门禁管理等，以预防类似事件的发生。
   • 完善规章制度：公司应完善内部规章制度，明确偷窃行为的定义和处罚措施，提高员工的法律意识和道德观念。
   • 开展培训：公司可以定期开展法律培训和道德教育，提高员工的法律素养和道德水平，减少偷窃等违法行为的发生。

建议：公司在处理此类事件时，应确保程序合法、证据确凿，并遵循公平、公正、公开的原则。如有需要，公司可以寻求法律专业人士的帮助，以确保处理结果的合法性和有效性。若您在处理过程中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询。