结论：企业员工将收到的好处费汇入公司账号是否违法，需根据具体情况判断，可能涉及违法也可能不违法。以下从不同角度进行分析：
一、可能违法的情况
好处费性质为贿赂：
- 如果员工收到的好处费是他人为了获取不正当利益（如业务机会、合同签订等）而给予的贿赂，那么无论员工是否将这笔钱汇入公司账号，都构成受贿行为，是违法的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第一百六十三条，公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，索取他人财物或者非法收受他人财物，为他人谋取利益的，是受贿罪。即使将贿赂款汇入公司账号，也不能改变其受贿的性质。
公司账号使用不当：
- 如果员工未经公司授权或违反公司规定，擅自将个人收到的好处费汇入公司账号，可能构成对公司财产权的侵害或违反公司财务管理制度，也是违法的。
- 分析：公司账号是公司用于经营活动的资金往来账户，员工个人资金（尤其是非法所得）不应随意汇入。这种行为可能干扰公司正常的财务管理，甚至可能掩盖非法活动。
二、可能不违法的情况
好处费性质合法且经公司同意：
- 如果员工收到的好处费是合法的奖励、佣金或回扣（在符合法律法规和行业规范的前提下），并且经过公司同意或授权汇入公司账号，那么这种行为可能是合法的。
- 示例：某些行业允许支付合理的佣金或回扣作为业务推广的费用，只要这些费用是公开透明的，并且符合相关法律法规和行业规范，就可以合法地汇入公司账号。
员工主动上缴非法所得：
- 如果员工意识到收到的好处费是非法所得（如贿赂），并主动将其汇入公司账号作为上缴或处理的方式，虽然这种行为本身不能改变其之前受贿的事实（如果已构成受贿），但可能作为量刑时的考虑因素，表明其有悔罪表现。
- 分析：在这种情况下，员工的行为更多是一种补救措施，而不是合法的资金往来。然而，从积极的角度看，它体现了员工对法律的尊重和对错误的认识。
三、法律建议
对于员工：
- 如果收到好处费，应首先判断其性质是否合法。如果怀疑或确认是非法所得（如贿赂），应立即拒绝并向上级或相关部门报告。
- 如果好处费是合法的奖励、佣金或回扣，应确保经过公司同意或授权后再进行汇款，并保留相关证据以备查。
对于公司：
- 应建立健全的财务管理制度和内部控制机制，防止员工擅自将个人资金汇入公司账号。
- 加强对员工的法律培训和职业道德教育，提高员工的法律意识和合规意识。
进一步思考：在实际操作中，企业员工将收到的好处费汇入公司账号的行为可能涉及复杂的法律关系和事实认定。因此，在遇到类似情况时，建议及时咨询专业律师以获取准确的法律意见和指导。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。