结论：在法人更换后新签补充协议时，应盖新任法人的法人章。

详细分析：

1. 法人更换的法律效果：

   • 法人更换，即公司的法定代表人发生变更，是公司内部管理结构的一种调整。根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，法定代表人代表公司行使职权，其变更需依法进行登记并公告，以确保外部第三人能够知晓并适应这种变更。

2. 补充协议的法律性质：

   • 补充协议是对原合同内容的补充或修改，它同样具有法律效力，并受合同法的调整。在签订补充协议时，需要确保协议双方（即公司和另一方合同主体）的代表或授权人具有合法的签约资格。

3. 法人章的使用：

   • 法人章是公司法定代表人的个人名章，用于代表公司签署法律文件。在法人更换后，原任法人的法人章即失去代表公司签署文件的法律效力，而应由新任法人使用其个人名章（即新的法人章）来代表公司签署文件。

4. 实际操作建议：

   • 在法人更换后，公司应及时办理相关变更登记手续，并公告于众，以确保外部第三人能够知晓新任法人的身份。
   • 在签订补充协议时，应明确由新任法人签署并加盖其个人名章（即新的法人章），以确保协议的法律效力。
   • 如果原合同中有关于法人变更后补充协议签署方式的特别约定，应遵循该约定执行；但若无特别约定，则应按照上述原则处理。

可能遇到的法律后果：

• 如果错误地使用了原任法人的法人章签署补充协议，可能会导致协议被认定为无效或存在法律瑕疵，从而给公司带来不必要的法律风险和经济损失。
• 因此，在法人更换后签订补充协议时，务必确保使用新任法人的法人章，并遵循相关法律法规和合同约定。

进一步建议：

• 在进行法人更换和签订补充协议等法律行为时，建议咨询专业律师以确保合法合规。
• 公司应建立健全内部管理制度，明确法人变更、合同签署等关键环节的流程和责任，以降低法律风险。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。