结论：母亲、儿子、女儿三人自行签订的房产分配协议，在符合一定条件下是具有法律效应的。不过，具体效力还需根据协议内容、签订时的具体情况以及后续行为等多方面因素来综合判断。
分析说明：
协议的有效性条件：
- 自愿性：协议必须是各方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。如果有一方是在被强迫或欺骗的情况下签订的协议，那么该协议可能被视为无效。
- 合法性：协议内容必须合法，不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。例如，协议中不能包含非法剥夺他人继承权或违反法律规定的条款。
- 明确性：协议内容应当明确具体，包括房产的具体信息、分配方式、各方的权利和义务等。如果协议内容模糊不清，可能导致后续执行困难或产生纠纷。
房产的权属情况：
- 如果房产是父亲和母亲共同所有的财产，那么在父亲去世后，母亲作为共同共有人，对房产享有相应的份额。在签订房产分配协议时，需要考虑到母亲的份额以及她对房产的处置权。
- 如果房产是父亲的个人财产，那么在他去世后，该房产应按照法定继承或遗嘱继承的方式进行处理。在这种情况下，母亲、儿子、女儿作为法定继承人，有权参与房产的分配。但自行签订的协议需要确保不违反法定继承的原则和顺序。
后续行为的影响：
- 协议签订后，各方应当按照协议内容履行自己的义务。如果有一方不履行或违反协议，另一方可以依法追究其责任。
- 如果协议签订后，房产的权属情况发生了变化（如母亲将房产转让给了他人），那么协议的效力可能会受到影响。此时，需要根据具体情况来判断协议是否仍然有效或需要如何调整。
特殊场景：
- 如果协议中涉及到了对其他继承人的权益的剥夺或限制，且没有得到其他继承人的同意或认可，那么该协议可能因侵犯他人权益而被视为无效或部分无效。
- 如果协议签订时，母亲已经丧失了民事行为能力（如患有严重精神疾病），那么她签订的协议可能因缺乏民事行为能力而被视为无效。
建议与行动：
- 在签订房产分配协议前，建议各方先进行充分的沟通和协商，确保协议内容符合各方的真实意愿和利益。
- 协议内容应当明确具体、合法合规，并尽量考虑到可能出现的各种情况和问题。
- 如果可能的话，可以请专业的律师对协议进行审查和修改，以确保其合法性和有效性。
- 协议签订后，各方应当妥善保管好协议原件，并按照协议内容履行自己的义务。如有任何争议或问题，应及时咨询专业律师并寻求法律帮助。
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