您好，关于在饮用水源二级保护区内建设自来水厂是否合法的问题，这主要取决于该自来水厂的建设和运营是否会产生污染物排放。

首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国水污染防治法》的相关规定，在饮用水水源二级保护区内，是禁止新建、改建、扩建排放污染物的建设项目的。这是为了保护饮用水源的安全，防止水源受到污染，从而保障公众的饮用水健康。

对于自来水厂来说，虽然其目的是为了提供清洁的饮用水，但在建设和运营过程中，如果涉及到排放污染物（如废水、废气、废渣等），那么这样的建设项目在饮用水源二级保护区内就是不被允许的。

然而，如果自来水厂的建设和运营能够确保不排放任何污染物，或者其排放的污染物能够达到国家规定的排放标准，并且经过了相关环保部门的严格审批和监管，那么理论上这样的建设项目在特定条件下可能是被允许的。但在实际操作中，这种情况较为罕见，因为自来水厂的生产过程往往难以完全避免污染物的产生。

因此，我的建议是：在饮用水源二级保护区内建设自来水厂需要特别谨慎。在决定建设之前，应该充分咨询当地环保部门和相关法律法规，确保建设项目的合法性和环保性。如果确实需要在该区域内建设自来水厂，那么必须采取严格的环保措施，确保不会对饮用水源造成任何污染。

总的来说，保护饮用水源是我们每个人的责任，我们应该共同努力，确保我们的饮用水安全、清洁、健康。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。