原法院在调解书生效三年后再审期间中止本调解书的执行，这一做法在符合法定条件的情况下是合法的。以下从多个角度进行分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，人民法院按照审判监督程序再审的案件，如果发生法定的中止执行情形，应当裁定中止执行。这些法定情形包括但不限于：

1. 申请人表示可以延期执行的：如果再审申请人表示愿意等待再审结果，不急于执行原调解书，法院可以考虑中止执行。
2. 案外人对执行标的提出确有理由的异议的：如果案外人提出异议，且该异议有充分理由支持，法院可能会中止执行以审查异议。
3. 作为一方当事人的公民死亡，需要等待继承人继承权利或者承担义务的：在公民死亡的情况下，需要等待其继承人表明是否继续执行或承担相关义务。
4. 作为一方当事人的法人或者其他组织终止，尚未确定权利义务承受人的：法人或其他组织终止后，需要确定其权利义务的承受人，此期间可能中止执行。
5. 人民法院认为应当中止执行的其他情形：这是一个兜底条款，涵盖了其他可能的中止执行情形。

二、再审期间中止执行的合理性

1. 保护当事人权益：再审程序是对原判决、裁定或调解书的重新审查，如果在此期间继续执行，可能会对当事人的权益造成不可逆转的损害。因此，中止执行可以保护当事人的合法权益。
2. 维护司法公正：再审程序旨在纠正可能存在的错误判决、裁定或调解书。如果在此期间不中止执行，可能会影响再审程序的公正性和有效性。
3. 遵循法定程序：法院在再审期间中止执行，是遵循法定程序的表现。这有助于确保司法活动的合法性和规范性。

三、实际操作中的注意事项

1. 严格审查中止执行条件：法院在决定中止执行时，应严格审查是否符合法定条件。避免滥用中止执行权力，损害当事人的合法权益。
2. 及时通知当事人：法院在作出中止执行裁定后，应及时通知双方当事人。确保当事人了解执行状态的变化，并有机会采取相应的法律措施。
3. 关注再审结果：中止执行期间，法院应密切关注再审程序的进展。一旦再审程序结束，法院应根据再审结果及时恢复执行或作出其他相应处理。

四、可能存在的争议点

虽然再审期间中止执行在符合法定条件的情况下是合法的，但也可能存在一些争议点。例如：

1. 中止执行期限的合理性：有人可能认为中止执行期限过长，影响了执行效率。对此，法院应在确保再审程序公正性的前提下，尽量缩短中止执行期限。
2. 中止执行对当事人利益的影响：中止执行可能会对一方当事人的利益造成不利影响。对此，法院应充分考虑当事人的实际情况，必要时可以采取保全措施等措施来平衡双方利益。

总结来说，原法院在调解书生效三年后再审期间中止本调解书的执行，在符合法定条件的情况下是合法的。这一做法有助于保护当事人权益、维护司法公正和遵循法定程序。如果您对具体案件的中止执行决定有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。