调解书约定履行期限在三年后，到期后若对方未履行，您仍然可以申请执行，但需注意诉讼时效问题。以下从不同角度为您详细分析：

1. 执行申请的期限起点
   根据《民事诉讼法》第2四十六条，申请执行的期间为二年，从法律文书规定履行期间的最后一日起计算。若调解书约定对方需在三年后履行（例如2024年1月1日签订调解书，约定2027年1月1日付款），则您需在2027年1月2日至2029年1月1日期间申请执行。若超过此期限，法院将不再受理，除非对方自愿履行或您能证明存在时效中断/中止情形（如对方书面同意延期、您曾催告等）。

2. 诉讼时效的特殊风险
   若调解书未明确约定履行期限，或约定的是“分期履行”（如每年支付一部分），则诉讼时效从最后一期履行期限届满之日起算。但若约定的是“三年后一次性履行”，需警惕对方可能以“超过三年诉讼时效”为由抗辩（尽管执行时效是二年，但诉讼时效可能影响权利主张）。建议：在履行期限届满前，通过书面催告、律师函等方式固定权利主张，避免时效问题。

3. 调解书与判决书的效力差异
   调解书经双方签字确认后，与判决书具有同等法律效力，法院可直接强制执行。但若对方在履行期限届满前转移财产、隐匿资产，您可依据《民法典》第538条申请撤销权（需在知道撤销事由之日起一年内行使），或提前申请财产保全（需提供担保，且需在调解书生效后、履行期限届满前提出）。

行动建议：

• 立即核对调解书中的履行期限条款，明确具体到期日；
  
• 在履行期限届满前，定期通过书面形式（如EMS邮寄催告函）留存权利主张证据；
  
• 若发现对方有逃避履行迹象，可提前咨询律师，评估是否需要申请财产保全或撤销权诉讼。
  

如有其他细节需要补充（如调解书是否涉及不动产、对方财产状况等），可进一步说明，我会为您细化分析。