结论：公司对普通工种可以协商解除劳动合同，而限制特殊工种不能协商解除，这一做法并非完全基于某一明确的、单一的法律依据，而是可能涉及多个法律条款的综合考量，包括但不限于《中华人民共和国劳动合同法》中关于劳动合同解除的相关规定，以及特殊工种保护的相关法律法规。以下是对此问题的详细分析：
一、劳动合同解除的一般规定
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同的解除可以由双方协商一致进行。这意味着，在一般情况下，无论是普通工种还是特殊工种，只要双方达成一致，都可以协商解除劳动合同。然而，对于特殊工种，法律可能设定了更为严格的保护措施，以防止其因协商解除而遭受不公平待遇。
二、特殊工种的保护
特殊工种的定义：特殊工种通常指的是那些因工作性质、工作环境或工作条件等因素，对劳动者身体健康有特殊影响的工种。这些工种可能涉及高温、高压、有毒有害、高空作业等危险或恶劣的工作环境。
保护措施：为了保障特殊工种劳动者的权益，法律可能规定了更为严格的劳动合同解除条件。例如，对于从事有毒有害工种的劳动者，法律可能要求用人单位在解除劳动合同时，必须提供充分的健康检查报告，证明劳动者未因工作而受到健康损害，或者必须支付额外的经济补偿等。
协商解除的限制：虽然法律并未明确禁止特殊工种劳动合同的协商解除，但基于特殊工种的保护原则，用人单位在提出协商解除时，可能需要承担更多的举证责任，证明解除劳动合同的合法性和合理性，以及已经采取了必要的保护措施。这可能导致在实际操作中，特殊工种的协商解除受到更多的限制。
三、实际操作中的考量
用人单位的自主权：用人单位在解除劳动合同时，虽然享有一定的自主权，但必须遵守法律法规的规定，不得侵犯劳动者的合法权益。对于特殊工种，用人单位在行使自主权时，应更加谨慎，确保解除劳动合同的合法性和合理性。
劳动者的权益保护：特殊工种劳动者在面对协商解除劳动合同时，应充分了解自己的权益，如经济补偿、健康检查等，并在必要时寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
四、建议
对于用人单位：在提出与特殊工种劳动者协商解除劳动合同时，应充分了解相关法律法规的规定，确保解除劳动合同的合法性和合理性。同时，应积极与劳动者沟通，提供必要的健康检查和经济补偿等，以维护劳动者的合法权益。
对于劳动者：在面对协商解除劳动合同时，应充分了解自己的权益和法律法规的规定。如有疑问或需要帮助，应及时咨询专业律师或相关机构，以维护自己的合法权益。
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