结论前置：医疗期满后，员工拒绝进行劳动能力鉴定并请病假，公司是否可以不批准并以事假处理，需分情况讨论。一般来说，若员工确实存在需要继续治疗的疾病且符合病假条件，公司不批准病假并以事假处理可能不合理且违法；若员工无法提供充分证据证明其需要继续病假，公司则有权根据实际情况处理。
一、员工医疗期满后的权利与义务
医疗期满后的处理：根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期满后，员工应当进行劳动能力鉴定。若鉴定结果显示员工仍不能从事原工作，也不能从事用人单位另行安排的工作的，用人单位可以解除劳动合同，但需按照法律规定支付经济补偿金。
拒绝劳动能力鉴定的后果：员工拒绝进行劳动能力鉴定，可能会影响其后续的权益主张。因为劳动能力鉴定是确定员工是否丧失劳动能力、丧失何种劳动能力以及丧失劳动能力的程度的重要依据。若员工拒绝鉴定，用人单位可能无法准确判断其劳动能力状况，从而难以做出合理的处理决定。
二、公司对病假申请的处理
病假申请的批准条件：员工请病假，通常需要提供正规医疗机构出具的诊断证明、病假单等材料，以证明其确实需要停止工作治病休息。若员工能够提供充分的证据证明其需要继续病假，公司应当批准其病假申请。
公司不批准病假的可能情况：
以事假处理的问题：若公司不批准员工的病假申请，并直接以事假处理，这可能存在问题。因为事假通常用于员工处理个人事务，而非因病需要停止工作治病休息。若员工确实因病需要休息，而公司却以事假处理，可能侵犯了员工的合法权益。
三、法律建议与维权途径
员工应积极配合劳动能力鉴定：为了维护自己的合法权益，员工应当积极配合进行劳动能力鉴定。这有助于明确自己的劳动能力状况，为后续的权益主张提供依据。
保留相关证据：员工在请病假过程中，应当妥善保留相关证据，如诊断证明、病假单、请假申请记录等。这些证据在后续可能发生的纠纷中，将起到至关重要的作用。
与公司沟通协商：若公司不批准病假申请，员工应当首先与公司进行沟通协商，说明自己的病情和请假的合理性，争取公司的理解和认可。
寻求法律援助：若沟通协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁、提起诉讼来维护自己的合法权益。
四、具体案例分析
假设员工小张医疗期满后拒绝进行劳动能力鉴定，并请病假。若小张能够提供正规医疗机构出具的诊断证明、病假单等材料，证明其确实需要继续停止工作治病休息，那么公司应当批准其病假申请。若公司不批准并以事假处理，小张可以通过沟通协商、投诉、仲裁或诉讼等途径来维护自己的合法权益。
反之，若小张无法提供充分的证据证明其需要继续病假，或者拒绝提供相关证据，那么公司有权根据实际情况不批准其病假申请，并可能以事假或其他方式处理。但在此情况下，公司也应当确保处理程序的公正性和合法性，避免侵犯员工的合法权益。
综上所述，医疗期满后员工拒绝劳动能力鉴定并请病假，公司是否可以不批准并以事假处理，需根据具体情况进行判断。员工应当积极配合劳动能力鉴定，保留相关证据，并在必要时寻求法律援助来维护自己的合法权益。