不能直接按旷工处理。针对您提出的“因病非因工医疗期满拒不配合劳动能力鉴定能否按旷工处理”的问题，我们需要从多个角度进行分析。

法律背景与规定

首先，我们要明确的是，员工因病或非因工负伤在医疗期内享有法定的医疗期，这是为了保障员工在患病或受伤期间能够得到充分的休息和治疗。医疗期满后，如果员工仍然不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作，那么根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，用人单位有权解除劳动合同，但需要提前通知员工并支付经济补偿金。

然而，关于劳动能力鉴定，这通常是确定员工是否能够继续从事原工作或另行安排的工作的重要依据。如果员工在医疗期满后拒不配合进行劳动能力鉴定，用人单位并不能直接将其视为旷工处理。

可能的法律后果与建议

1. 不能直接按旷工处理：旷工通常指的是员工未经批准擅自缺勤的行为。而员工拒不配合劳动能力鉴定，并不等同于擅自缺勤。因此，用人单位不能直接将其视为旷工并据此进行处罚。

2. 解除劳动合同的合法性：如果员工在医疗期满后，既不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作，并且拒不配合进行劳动能力鉴定，用人单位在符合法定程序和条件的情况下，可以解除劳动合同。但这一过程需要遵循严格的法律程序，包括提前通知、支付经济补偿金等。

3. 建议与措施：

   • 沟通协商：用人单位可以尝试与员工进行沟通协商，了解其拒不配合劳动能力鉴定的原因，并寻求解决方案。
   • 发送书面通知：如果沟通无果，用人单位可以向员工发送书面通知，要求其在规定时间内配合进行劳动能力鉴定，并告知其不配合的后果。
   • 依法处理：如果员工仍然拒不配合，用人单位可以依据相关法律法规和公司规章制度，依法解除劳动合同，并支付相应的经济补偿金。

实际操作中的注意事项

在实际操作中，用人单位需要注意以下几点：

• 确保程序合法：在解除劳动合同的过程中，用人单位需要确保所有程序都符合法律法规的规定，避免出现违法解除的情况。
• 保留证据：用人单位需要保留好与员工沟通协商的记录、书面通知等证据，以备不时之需。
• 关注员工权益：在处理此类问题时，用人单位也需要关注员工的合法权益，确保其得到公正、合理的对待。

综上所述，因病非因工医疗期满拒不配合劳动能力鉴定不能直接按旷工处理。用人单位需要依据相关法律法规和公司规章制度，通过沟通协商、发送书面通知等方式，依法、合理地处理此类问题。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。