个体工商户追回员工造成的损失，需根据具体情况选择合法途径，核心结论如下：

1. 明确损失性质与责任归属
   首先需确认损失是否由员工故意或重大过失导致。若员工因一般过失（如轻微疏忽）造成损失，根据《工资支付暂行规定》第16条，用人单位可要求员工赔偿，但每月扣除部分不得超过当月工资的20%，且扣除后工资不得低于当地最低工资标准。若损失由员工故意或重大过失（如盗窃、违规操作导致重大事故）造成，则可全额追偿，且不受工资扣除比例限制。

2. 协商与调解优先
   建议先与员工沟通，明确损失金额及责任划分，尝试通过协商达成赔偿协议。若协商无果，可向当地劳动争议调解组织（如街道调解委员会）申请调解，降低维权成本。

3. 法律途径追偿

   • 劳动仲裁：若员工拒绝赔偿，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，需提供证据（如劳动合同、损失证明、员工过错证据等）。仲裁裁决具有法律效力，若员工不履行，可申请法院强制执行。
     
   • 民事诉讼：若损失金额较大或涉及非劳动关系（如临时用工），可直接向法院提起民事诉讼，要求员工赔偿实际损失。需注意，诉讼需承担举证责任，需准备充分证据（如监控录像、财务记录、第三方鉴定报告等）。

4. 特殊情形处理

   • 第三方责任：若损失由员工与第三方共同造成，可要求员工与第三方承担连带责任。
     
   • 保险理赔：若购买了雇主责任险或财产保险，可先向保险公司索赔，再由保险公司向员工追偿（需保险合同约定）。
     
   • 刑事报案：若员工行为涉嫌犯罪（如职务侵占、故意毁坏财物），可向公安机关报案，通过刑事程序追偿并追究刑事责任。

行动建议：

1. 立即固定证据（如损失清单、员工过错证明、沟通记录等）；
   
2. 根据损失金额和员工态度，选择协商、调解或法律途径；
   
3. 若涉及复杂法律问题（如证据收集、程序选择），可直接向我咨询，我会结合具体案情提供详细方案。