您好，关于特殊工时制的考勤问题，这确实是一个涉及劳动法规且较为细致的话题。下面我将结合相关政策，为您详细解答。

首先，我们需要明确特殊工时制主要包括两种：综合计算工时工作制和不定时工作制。

一、综合计算工时工作制

这种工时制是针对因工作性质特殊，需连续作业或受季节及自然条件限制的企业部分职工而设定的。它采用以周、月、季、半年、年为周期综合计算工作时间的方式。在这种制度下，虽然职工的工作时间可能在某个周期内超过标准工时，但平均日工作时间和平均周工作时间应当与法定标准工作时间基本相同。

考勤要点：

1. 周期计算：企业需明确综合计算工时的周期（如周、月、季等），并在此周期内统计职工的总工作时间。
2. 加班限制：在综合计算周期内，如果职工的总工作时间超过法定标准工作时间，超出部分应视为加班，并按照相关规定支付加班费。但需注意，每日和每月的加班时间也有上限，以保障职工的身体健康。
3. 休息安排：企业应合理安排职工的工作和休息时间，确保职工在综合计算周期内能够得到足够的休息。

二、不定时工作制

不定时工作制则是针对因生产特点、工作特殊需要或职责范围的关系，无法按标准工作时间衡量或需要机动作业的职工而设定的。这种工时制下，职工的工作时间更加灵活，不受标准工时的限制。

考勤要点：

1. 岗位确定：企业应明确哪些岗位适合实行不定时工作制，如高级管理岗位、技术、研发、创作等岗位，以及需要机动作业的外勤、推销、长途运输等岗位。
2. 自主安排：在不定时工作制下，职工可以自主安排工作时间，企业无需对其进行严格的考勤管理。但职工仍需确保完成工作任务，并遵守企业的其他相关规定。
3. 业绩考核：虽然不定时工作制下职工的工作时间灵活，但企业仍需建立合理的业绩考核机制，以评估职工的工作表现。

三、特殊工时制的申请与审批

企业如果需要实行特殊工时制，应向所在地的政府服务中心行政审批部门进行申请，并提交相关材料。审批部门将根据企业的实际情况和劳动法规进行审批，并给出具体的审批意见。

四、注意事项

1. 合法合规：企业在实行特殊工时制时，必须确保合法合规，遵守相关劳动法规和政策。
2. 职工权益：企业应切实保障职工的休息休假权利，合理安排职工的工作和休息时间。
3. 沟通协商：在实行特殊工时制前，企业应与职工进行充分的沟通和协商，确保职工对工时制的理解和接受。

综上所述，特殊工时制的考勤管理需要根据具体的工时制度类型来制定相应的策略。企业应结合自身实际情况和劳动法规要求，合理确定考勤方式和管理措施，以确保职工的权益得到保障，同时提高企业的运营效率。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。