结论：员工因脚疼离职，公司扣钱是否合法，需根据具体情况判断。一般来说，如果员工因个人健康原因离职，且符合法定或公司规定的离职程序，公司扣钱通常不合法；但如果员工离职违反了公司规定或劳动合同中的特定条款，且这些条款不违反法律法规，公司扣钱可能有其合理性，但需谨慎处理。
分析：
法定离职权利与程序：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，员工有权因个人原因（包括健康问题）提出离职。员工应提前通知公司，并按照公司规定的程序办理离职手续。
- 如果员工因脚疼等健康原因需要立即离职，且能提供相应的医疗证明，公司应理解并协助员工办理离职手续，而不应无故扣钱。
公司扣钱的合法性依据：
- 公司扣钱通常需要有合法的依据，如劳动合同中的特定条款、公司规章制度或法律法规的明确规定。
- 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了员工在特定情况下离职需要承担的经济责任（如未提前通知的违约金、培训费用等），且这些条款不违反法律法规的强制性规定，公司扣钱可能有其合理性。
- 然而，如果公司扣钱没有合法的依据，或者扣钱的金额、方式等违反了法律法规的规定，那么公司的行为就是违法的。
特殊情况下的处理：
- 如果员工因脚疼等健康原因离职，且能提供医疗证明，但公司仍坚持扣钱，员工可以与公司进行协商，寻求合理的解决方案。
- 如果协商无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
建议：
- 对于员工：在离职前，应仔细阅读劳动合同和公司规章制度，了解自己的权利和义务。如果因健康原因需要离职，应提前与公司沟通，并按照公司规定的程序办理离职手续。如果公司扣钱，应要求公司提供合法的依据，并保留好相关证据，以便在必要时维护自己的权益。
- 对于公司：在处理员工离职时，应遵守法律法规的规定，尊重员工的合法权益。如果员工因健康原因离职，公司应给予理解和支持，而不是无故扣钱。如果公司需要员工承担一定的经济责任，应在劳动合同或公司规章制度中明确规定，并确保这些条款不违反法律法规的强制性规定。
可能后果：
- 如果公司无故扣钱，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司返还被扣的钱款，并可能获得相应的赔偿。
- 如果公司扣钱有合法的依据，但员工认为扣钱的金额或方式不合理，也可以通过法律途径寻求解决方案。
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