结论：公司注销多年后，劳动关系确认的案件法院是否受理，需视具体情况而定，但通常情况下，若符合一定条件，法院是会受理的。以下从多个角度进行详细分析：
公司注销后的法律地位：
- 公司注销意味着其法人资格的终止，即公司作为法律主体的消失。然而，这并不意味着与公司相关的所有法律关系都随之消灭。特别是涉及劳动关系的确认，往往与公司注销前的经营活动和员工权益紧密相关。
劳动关系确认的法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》及相关劳动法律法规，劳动者与用人单位之间因确认劳动关系发生的争议，属于劳动争议的范畴，劳动者有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。
- 即使公司已经注销，如果劳动者能够提供初步证据证明其与公司之间存在劳动关系，且该争议具有可诉性（即符合法院受理的条件），法院通常会受理此类案件。
法院受理的条件：
- 主体资格：虽然公司已注销，但劳动者仍可以作为原告提起诉讼。被告方面，可能需要将公司的股东、清算义务人等作为共同被告或第三人，以查明事实并确定责任承担。
- 诉讼请求的明确性：劳动者需要明确其诉讼请求，即要求确认与公司之间存在劳动关系，并可能涉及相关权益的诉求（如工资、社保等）。
- 证据的充分性：劳动者需要提供足够的证据来支持其诉讼请求，如劳动合同、工资单、工作证、同事证言等。
- 时效性：虽然公司注销可能影响诉讼时效的计算，但劳动者仍需在法定时效期间内提起诉讼，否则可能丧失胜诉权。
实际操作中的考虑：
- 在实际操作中，由于公司已注销，调查取证可能变得更为困难。因此，劳动者在提起诉讼前应尽可能收集相关证据，并咨询专业律师以制定合适的诉讼策略。
- 法院在受理此类案件时，可能会要求劳动者提供更多关于公司注销前的经营状况、员工名单、工资发放记录等信息，以便查明事实。
可能的法律后果：
- 如果法院最终确认劳动者与公司之间存在劳动关系，那么劳动者有权要求公司（或其股东、清算义务人等）承担相应的法律责任，如支付工资、补缴社保等。
- 如果法院认为劳动者提供的证据不足或诉讼请求不成立，则可能驳回劳动者的诉讼请求。
建议：如果您面临公司注销多年后劳动关系确认的问题，建议您首先收集相关证据，并咨询专业律师以评估案件的可行性和诉讼风险。在律师的指导下，您可以更有效地维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。