公司以宗教信仰劝退员工，员工是可以申请劳动仲裁的。以下从几个方面为你详细分析：
法律背景与依据
根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者享有平等就业和选择职业的权利，用人单位不得因民族、种族、性别、宗教信仰等不同对劳动者实施歧视。公司以宗教信仰为由劝退员工，显然违反了这一原则，构成了对员工平等就业权的侵犯。
劳动仲裁的适用性
劳动仲裁是解决劳动争议的一种重要方式，它适用于因确认劳动关系、订立、履行、变更、解除和终止劳动合同、工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护等发生的争议。在你所描述的情况下，公司以宗教信仰为由劝退员工，属于因解除劳动合同而引发的争议，因此完全适用劳动仲裁来解决。
仲裁流程与注意事项
准备证据：在申请劳动仲裁前，你需要收集并整理好相关证据，如劳动合同、公司劝退的书面通知或录音、与公司的沟通记录等，以证明公司确实存在以宗教信仰为由劝退你的行为。
提交仲裁申请：向当地劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，并附上相关证据材料。仲裁申请应明确你的仲裁请求，如要求公司继续履行劳动合同、支付违法解除劳动合同的赔偿金等。
参与仲裁过程：在仲裁过程中，你需要积极参与，如实陈述事实，提供证据，并回答仲裁员的提问。同时，你也可以委托律师代理你参与仲裁，以更好地维护你的权益。
执行仲裁结果：如果仲裁裁决支持了你的请求，公司应当履行裁决。如果公司不履行，你可以向人民法院申请强制执行。
可能的法律后果
如果公司确实存在以宗教信仰为由劝退员工的行为，且经劳动仲裁裁决确认违法，那么公司可能需要承担以下法律后果：
继续履行劳动合同：如果仲裁裁决要求公司继续履行劳动合同，公司应当恢复与你的劳动关系，并安排你回到原岗位工作。
支付赔偿金：如果仲裁裁决认定公司违法解除劳动合同，公司可能需要向你支付赔偿金。赔偿金的数额通常根据你的工作年限和工资水平来确定。
建议与提醒
在面对公司以宗教信仰为由劝退的情况时，我建议你保持冷静，不要轻易接受公司的劝退决定。你可以先与公司进行沟通协商，尝试解决问题。如果协商无果，你可以及时收集证据并申请劳动仲裁来维护自己的权益。
如果你在此过程中遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供更详细、更专业的法律建议。